FATTORI DI CRESCITA
FATTORI DI CRESCITA
Fattori di crescita FATTORI DI CRESCITA Recettori
FATTORI DI CRESCITA Proliferazione Differenziamento
FATTORI DI CRESCITA? Come fa una interazione tra due molecole sulla superficie cellulare a raggiungere il nucleo per attivare la trascrizione di mrna e la traduzione proteica?
STUDIO INTERAZIONE RECETTORE-LIGANDO 1. Analisi dell equilibrio di legame a saturazione 2. Cross-linking + 125 I + iodogen bolton-hunter lactoperoxidase 125 I 125 I 125 I 125 I
Protein + Na 125 I + Protein + Na 125 I +
Analisi dell equilibrio di legame a saturazione (Scatchard plot) Cellule GM7373 180.000 cells/pozzetto in piastra da 48 pozzetti Aggiunti 100 microlitri di terreno/pozzetto contenente 125 I-FGF2 4 ng/ml, 8 ng/ml, 16 ng/ml, 40 ng/ml, 80 ng/ml, 100 ng/ml +/- FGF2 300x Campioni in quintuplicato 125 I-FGF2: attività specifica 358 CPM/fmole I VALORI SONO OTTENUTI DA HOT medio COLD medio [ 125 I-FGF2] CPM caricate Lavaggio F ph4 4 ng/ml 9936 8632 24.11 245 8 ng/ml 14306 12975 36.24 302 16 ng/ml 28995 26441 73.85 411 40 ng/ml 78385 72462 202.40 563 80 ng/ml 154666 143609 401.14 1063 B 0.68 0.84 1.15 1.57 2.97 B/F 0.028 0.023 0.0156 0.0078 0.0074
Analisi dell equilibrio di legame a saturazione (Scatchard plot) 125 I-GF 125 125 I-GF 125 I-GF 125 I-GF I-GF 125 I-GF 125 I-GF Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y T = binding totale NSB = binding non specifico (non saturabile) SB = binding specifico
F B B/F 24.11 0.68 0.028 36.24 0.84 0.023 73.85 202.40 1.15 1.57 0.0156 0.0078? 401.14 2.97 0.0074 B rappresenta il coefficiente angolare Quando Y=0 X=1,89 fmoli N rec/cell = 1.89 x 6.023 x 10 23 x 10-15 = 1,8 x 10 5 6.3 x 10 3 Ka= 1/B = 44.68 fmoli in 100 microlitri, Che equivale a 446 pm
Cross-linking 125 I-GF 125 125 I-GF 125 I-GF 125 I-GF I-GF 125 I-GF 125 I-GF Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y X 125 125 I-GF 125 I-GF 125 I-GF I-GF 125 I-GF 125 I-GF Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Bis(Sulfosuccinimidyl)suberate (BS 3 ) is a homobifunctional, water-soluble, non-cleavable and membrane impermeable cross-linker. It contains an amine-reactive N-hydroxysulfosuccinimide (NHS) ester at each end of an 8-carbon spacer arm. NHS esters react with primary amines at ph 7-9 to form stable amide bonds, along with release of the N-hydroxysulfosuccinimide leaving group. Proteins, including antibodies, generally have several primary amines in the side chain of lysine (K) residues and the N-terminus of each polypeptide that are available as targets for NHS-ester cross-linking reagents. http://www.piercenet.com/products/browse.cfm?fldid=02030212
Cross-linking 125 125 I-GF 125 I-GF 125 I-GF I-GF 125 I-GF 125 I-GF Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y Y + sample buffer FGF/FGFR SDS-PAGE Dry gel AUTORADIOGRAFIA
ATTIVAZIONE DEL SEGNALE
La trasduzione del segnale si perpetra attraverso eventi di fosforilazione
* + fattore di crescita SDS-PAGE * * * * Western blot
La trasduzione del segnale si protrae per integrazione dell informazione
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PROTEINE CHE LEGANO PDGFR ATTIVATO
Come identificare proteine legate al recettore? Immunoprecipitazione Recupera immunoprecipitato SDS/PAGE Western blot GF Aggiungi resina di Proteina A/G Lisi in tampone adeguato Aggiungi anticorpo anti recettore
Immunoprecipitazione Gli anticorpi si legano specificamente alle proteine A o G di staffilococco tramite la porzione Fc Lisato + anticorpo Lavaggio Tampone Eluizione
Immunoprecipitazione
Costruzione di un recettore chimerico Trasfezione in un background negativo Mutazione del recettore chimerico
Immunoprecipitazione di target intracellulare con peptide che mima il sito di legame al recettore: cromatografia di affinità
Analisi della fosforilazione del substrato come indice dell attivazione
Test di attivazione delle MAPK Far western
FGFR1 signal transduction OUT FGF2 FGF2 IN Src Crk P P P P P P Y730 Y463 Y583 Y585 Y653 Y654 P PLC- γ Y766 Y463 Y583 Y585 Y766 P P Y653 Y654 P Y730 P P Crk PLC- γ Shc Ras Raf MAP kinase pathway Jun-D 80K-H FRS2 Shp-2 Cytoplasm Nucleus
Specifiche tirosine fosforilate legano specifiche molecole
I trasduttori intracellulari posseggono domini modulari
Dominio SH2 Il nome deriva da una regione omologa nell oncogene src (src homology 2). I domini SH2 sono moduli di circa 100 aminoacidi che legano residui di tirosina fosforilata. La specificità di legame dipende dagli aminoacidi fiancheggianti la tirosina fosforilata.
Dominio PTB I domini leganti tirosine fosforilate sono moduli di 100-150 aa che legano motivi Asn-Pro-X-Tyr. In alcuni casi (Shc) la tirosina deve essere fosforilata. Dominio PTB di Shc legato al peptide HIIENPQpYFS
Dominio SH3 Il nome deriva da una regione omologa nell oncogene src (src homology 3). I domini SH3 generalmente legano peptidi ricchi in prolina (Pro-X-X-Pro) Dominio SH3 dell omologo di Grb2 legato al peptide PPPVPPRRR di Sos.
DAL RECETTORE A RAS Shc PTB SH2 Grb2 SH3 SH2 SH3 Sos Proline-rich Catalytic activity (GNRP)
LA PROTEINA RAS
LA PROTEINA RAS Le GTPasi monomeriche Sono tutte proteine che subiscono modificazioni lipidiche (farnesilazione e/o palmitoilazione) che ne consentono l ancoraggio alle membrane. Nel caso di Ras, l ancoraggio è sulla faccia citoplasmatica della membrana cellulare Cristallo di Ras legato a GTP
LA PROTEINA RAS La proteina Ras è attiva quando è legata a GTP, mentre è inattiva se legata a GDP. La sua attività viene regolata da altre due classi di proteine: 1. GTPase activating protein (GAP) che incrementano l idrolisi di GTP legato a Ras a GDP, favorendo l inattivazione della proteina 2. Guanine nucleotide exchange factor (GEF) che stimolano Ras a perdere GDP. La concentrazione di GTP nel citosol è 10 volte più alta di quella di GDP, quindi Ras tenderà a legare GTP una volta lasciato GDP.
Gli hotspot maggiori che, se mutati, portano all attivazione della proteina Ras si ritrovano in prossimità del legame a GTP. Le diverse mutazioni aminoacidiche decrementano l idrolisi del GTP da parte della proteine GAP. La molecola Ras mutata rimane prevalentemente legata a GTP e quindi costitutivamente attiva, nonostante l assenza di un segnale di stimolazione extracellulare.
DA RAS ALLA CASCATA DELLE MAP CHINASI La fosforilazione in tirosina e l attivazione di Ras sono eventi transitori e a vita breve. Pressochè immediata è l azione delle fosfatasi sui residui fosforilati e altrettanto veloce è l idrolisi del GTP a GDP. Per stimolare la proliferazione cellulare questi segnali devono essere tramutati in altri che durando più a lungo possono trasportare l informazione fino al nucleo. La cellula interviene con cascate di eventi di fosforilazione che hanno come bersaglio residui di serina e di treonina. CASCATA DELLE MAP (Mitogen-activated protein) CHINASI chiamate anche ERK (extracellular-signal-regulated) chinasi
CASCATA DELLE MAP CHINASI L attivazione delle MAP chinasi necessita della fosforilazione contemporanea di un residuo di treonina e di un residuo di tirosina. La proteina che può da sola catalizzare queste reazioni viene chiamata MAP chinasi-chinasi (MAPKK). A sua volta, questa proteina viene attivata, tramite fosforilazione in serina e treonina, dalla MAP chinasi chinasi chinasi (MAPKKK), che è il target di Ras.
CASCATA DELLE MAP CHINASI Nucleo La MAPK attivata trasloca dal citosol al nucleo, dove può fosforilare diversi substrati. Tra di essi i più importanti sono i fattori di trascrizione che consentono la produzione di nuovi mrna che codificano per proteine coinvolte nella replicazione cellulare.
ATTIVAZIONE DELLE MAP CHINASI
FGFR1 signal transduction
Saggi di attività chinasica
Inibitori di attività chinasica
Quale inibitore scegliere?
Inibitori chimici Inibitori biologici
Come utilizzare un inibitore di attività chinasica? +/- stimolo +/- inibitore Attivita biologica Ma a che dose?
Perché sono importanti gli inibitori di attività chinasica?
Selection of antitumor and antivascular drugs under investigation for cancer therapy
http://www.kinasenet.org/pkr/welcome.do http://www.biocarta.com/