Meccanismi molecolari di trasduzione del segnale III

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2 Recettori v. 1.2 gsartor 2012 M04 - Trasduzione del segnale II 3 Recettori canali ionici Il legame del ligando modifica la conformazione del recettore in modo tale che specifici ioni possono fluire attraverso esso, il risultante movimento ionico altera il potenziale elettrico della membrana cellulare. v. 1.2 gsartor 2012 M04 - Trasduzione del segnale II 4

3 Recettore dell acetilcolina I recettori per l acetilcolina sono presenti sulla superficie delle cellule muscolari concentrati nelle sinapsi Una forma simile si trova anche ne SNC e permette il passaggio dell informazione tra le cellule nervose Questi recettori sono composti di cinque catene proteiche arrangiate a formare una tubo che attraversa la membrana Due di queste catene sono il sito di legame dell acetilcolina, quando si lega la forma del recettore cambia leggermente aprendo il canale transmembrana Ciò permette il passaggio di ioni positivi (Na +, K +, Ca ++ ) attraverso la membrana. Le cellule muscolari pompano costantemente Na + verso l esterno. Quando arriva il segnale il canale si apre e Na + entra a favore di gradiente facendo partire il processo della contrazione muscolare. 2BG9 v. 1.2 gsartor 2012 M04 - Trasduzione del segnale II 5 Recettori v. 1.2 gsartor 2012 M04 - Trasduzione del segnale II 6

4 Recettori con attività enzimatica intrinseca Recettori transmembrana che contengono ed esprimono attività enzimatiche. Quando uno di questi recettori viene attivato da un ligando extracellulare, catalizza direttamente la produzione di un secondo messaggero intracellulare. v. 1.2 gsartor 2012 M04 - Trasduzione del segnale II 7 Molecole segnale Ligando segnale Epidermal Growth Factor (EGF) Insulina Insulin-like Growth Factor (IGF-1 e IGF-2 ) Nerve Growth Factor (NGF) Platelet-derived Growth Factor (PDGF AA, BB, AB) Macrophage-colony-stimulating factor (M-CSF) Fibroblast Growth Factor (FGF-1 -> FGF-24) Vascular Endothelial Growth Factor (VEGF) Recettore EGFR Rettore per l insulina IGFR-1 Trk A PDGFR (α e β) M-CSFR FGF-R1 -> FGF-R4 (e isoforme) VEGFR Risposte Stimola la proliferazione in diversi tipi di cellule Stimola l utilizzo dei carboidrati e la sintesi proteica Stimola la crescita cellulare e la sopravvivenza Stimola la crescita cellulare e la sopravvivenza di alcuni neuroni Stimola la sopravvivenza, la crescita e la proliferazione in diversi tipi di cellule Stimola la proliferazione e il differenziamento in monociti e macrofagi Stimola la proliferazione di diversi tipi di cellule, inibisce il differenziamento in alcuni precursori cellulari Stimola angiogenesi v. 1.2 gsartor 2012 M04 - Trasduzione del segnale II 8

5 9 v. 1.2 gsartor 2012 M04 - Trasduzione del segnale II 9 EGF EGFR Epidermal Growth Factor

6 v. 1.2 gsartor 2012 M04 - Trasduzione del segnale II 11 INTERAZIONE COL LIGANDO DIMERIZZAZIONE AUTOFOSFORILAZIONE / Attivazione (siti di legame ad alta affinità) ASSOCIAZIONE A PROTEINE TARGET FOSFORILAZIONE DI ALCUNE PROTEINE TARGET v. 1.2 gsartor 2012 M04 - Trasduzione del segnale II 12

7 INTERAZIONE COL LIGANDO DIMERIZZAZIONE AUTOFOSFORILAZIONE / Attivazione (siti di legame ad alta affinità) ASSOCIAZIONE A PROTEINE TARGET FOSFORILAZIONE DI ALCUNE PROTEINE TARGET v. 1.2 gsartor 2012 M04 - Trasduzione del segnale II 13 EGF EGF è un polipeptide di 53 AA stabilizzato da tre legami sulfidrilici. due molecole di EGF, A e B, interagiscono in una unità asimmetrica, formando un potenziale dimero. v. 1.2 gsartor 2012 M04 - Trasduzione del segnale II 14

8 EGF Alcuni aminoacidi sono indispensabili per il legame di EGF al suo recettore, suggerendo un ruolo cruciale nell indurre la dimerizzazione del recettore. I residui importanti ai fini dell interazione EGF/EGFR sono: Tyr13, Leu15, His16, Tyr37, Arg41, Gln43, Ile23, Ala25, Leu26, Leu47. v. 1.2 gsartor 2012 M04 - Trasduzione del segnale II 15 EGFR I recettori per EGF, chiamati ErbB-1, (dal gene, ErbB, derivato dall oncogene virale per il quale sono omologhi: Erythroblastic Leukemia Viral Oncogene) sono costituiti da una regione extracellulare costituita da circa 620 aminoacidi, una singola regione transmembrana, una regione citoplasmatica con attività tirosinkinasica e una corta regione che connette queste ultime. La regione extracellulare di ogni famiglia è fatta da quatto sottodomini: L1, CR1, L2 e CR2, dove "L" significa leucine-rich e "CR" significa cysteine-rich. v. 1.2 gsartor 2012 M04 - Trasduzione del segnale II 16

9 EGFR v. 1.2 gsartor 2012 M04 - Trasduzione del segnale II 17 ErbB L1 (blu), CR1 (verde), L2 (giallo), CR2 (rosso) Questi sottodomini sono anche chiamati domini I-IV, Files pdb: 1NQL (ErbB-1), 1S78 (ErbB-2), 1M6B (ErbB-3) and 2AHX (ErbB-4) v. 1.2 gsartor 2012 M04 - Trasduzione del segnale II 18

10 19 v. 1.2 gsartor 2012 M04 - Trasduzione del segnale II v. 1.2 gsartor 2012 M04 - Trasduzione del segnale II 20

11 INTERAZIONE COL LIGANDO DIMERIZZAZIONE AUTOFOSFORILAZIONE / Attivazione (siti di legame ad alta affinità) ASSOCIAZIONE A PROTEINE TARGET FOSFORILAZIONE DI ALCUNE PROTEINE TARGET v. 1.2 gsartor 2012 M04 - Trasduzione del segnale II 21 EGF EGF 3NJP v. 1.2 gsartor 2012 M04 - Trasduzione del segnale II 22

12 EGF EGF 3NJP v. 1.2 gsartor 2012 M04 - Trasduzione del segnale II 23 v. 1.2 gsartor 2012 M04 - Trasduzione del segnale II 24

13 v. 1.2 gsartor 2012 M04 - Trasduzione del segnale II 25 Model for molecular mechanism of ligand-induced EGFR activation. Lammerts van Bueren J J et al. PNAS 2008;105: v by National gsartor Academy 2012 of Sciences M04 - Trasduzione del segnale II 26

14 Dimerizzazione di EGFR v. 1.2 gsartor 2012 M04 - Trasduzione del segnale II 27 INTERAZIONE COL LIGANDO DIMERIZZAZIONE AUTOFOSFORILAZIONE / Attivazione (siti di legame ad alta affinità) ASSOCIAZIONE A PROTEINE TARGET FOSFORILAZIONE DI ALCUNE PROTEINE TARGET v. 1.2 gsartor 2012 M04 - Trasduzione del segnale II 28

15 Fosforilazione in tirosina O * N H * Proteina-tirosin-kinasi ADP ATP O * N H * OH PO H 2 O Proteina-tirosin-fosfatasi O P O O O v. 1.2 gsartor 2012 M04 - Trasduzione del segnale II 29 Autofosforilazione Avviene in due tappe: 1. Si fosforila il labbro di fosforilazione in prossimità del sito catalitico. Questo porta ad una variazione conformazionale che favorisce il legame dell ATP (recettore per l insulina) o l interazione con proteine target (FGFR). 2. Fosforilazione di altre Tyr del dominio citosolico Diventano siti di aggancio delle altre proteine coinvolte nella trasduzione del segnale. v. 1.2 gsartor 2012 M04 - Trasduzione del segnale II 30

16 Autofosforilazione Per alcuni recettori (insulina) le subunità sono legate in modo covalente e l autofosforilazione avviene solo in presenza dell agonista. v. 1.2 gsartor 2012 M04 - Trasduzione del segnale II 31 Autoregulatory Mechanisms in Protein-tyrosine Kinases Stevan R. Hubbard, Moosa Mohammadi, and Joseph Schlessinger J Biol Chem, Vol. 273, Issue 20, , May 15, 1998 v. 1.2 gsartor 2012 M04 - Trasduzione del segnale II 32

17 Dominio kinasico di EGFR v. 1.2 gsartor 2012 M04 - Trasduzione del segnale II 33 v. 1.2 gsartor 2012 M04 - Trasduzione del segnale II 34

18 v. 1.2 gsartor 2012 M04 - Trasduzione del segnale II 35 v. 1.2 gsartor 2012 M04 - Trasduzione del segnale II 36

20 v. 1.2 gsartor 2012 M04 - Trasduzione del segnale II 39 INTERAZIONE COL LIGANDO DIMERIZZAZIONE AUTOFOSFORILAZIONE / Attivazione (siti di legame ad alta affinità) ASSOCIAZIONE A PROTEINE TARGET FOSFORILAZIONE DI ALCUNE PROTEINE TARGET v. 1.2 gsartor 2012 M04 - Trasduzione del segnale II 40

21 Growth factor receptor-bound protein 2 v. 1.2 gsartor 2012 M04 - Trasduzione del segnale II 41 Proteine di raccordo GRB2 Growth factor receptor-bound protein 2 Contiene un dominio SH2 che lega sequenze di Tyr fosforilate e due domini SH3 che formano complessi con regioni ricche di prolina di altre proteine. SH3 SH2 SH3 1GRI v. 1.2 gsartor 2012 M04 - Trasduzione del segnale II 42

22 Proteine di raccordo Il dominio SH3 N-terminale lega sequenze ricche di prolina e lega Ras-guanine exchange factor SOS. Il dominio SH3 C-terminale lega peptidi che possiedono il motivo P- X-I/L/V/-D/N-R-X-X-K-P e si legano specificatamente a proteine come Gab-1. SH3 N-terminale SH3 C-terminale 1GRI v. 1.2 gsartor 2012 M04 - Trasduzione del segnale II 43 GRB2 v. 1.2 gsartor 2012 M04 - Trasduzione del segnale II 44

23 Src Homology 2 1KKA v. 1.2 gsartor 2012 M04 - Trasduzione del segnale II 45 SH3 1SHG v. 1.2 gsartor 2012 M04 - Trasduzione del segnale II 46

24 Src v. 1.2 gsartor 2012 M04 - Trasduzione del segnale II 47 Sarcoma di Rous v. 1.2 gsartor 2012 M04 - Trasduzione del segnale II 48

25 20.4 Analysis of eye development in Drosophila has provided insight into RTK signaling pathways Wild-type sevenless mutant Figure v. 1.2 gsartor 2012 M04 - Trasduzione del segnale II Genetic analysis of induction of R7 photoreceptor in the Drosophila eye Figure v. 1.2 gsartor 2012 M04 - Trasduzione del segnale II 50

26 Sos-Ras Sos viene rilocalizzato dal citosol alla membrana dopo legame con GRB2 che lo porta a contatto con Ras-GDP; Il contatto Sos Ras-GDP provoca variazioni conformazionali nelle zone Switch I e Switch II; Si apre la tasca che lega il GDP che scambia con il GTP (100 volte più concentrato nella cellula); v. 1.2 gsartor 2012 M04 - Trasduzione del segnale II 51 Son of Sevenless (SOS) RAS:SOS:RAS-GDP 1XD2 v. 1.2 gsartor 2012 M04 - Trasduzione del segnale II 52

27 Ras v. 1.2 gsartor 2012 M04 - Trasduzione del segnale II 53 v. 1.2 gsartor 2012 M04 - Trasduzione del segnale II 54

28 GEF: fattore di scambio dei nucleotidi guaninici GAP: proteina che attiva la GTPasi. Ras non possiede il residuo di Arg nell interruttore I che stabilizza la transizione quindi interviene una GAP. La struttura del complesso Ras-GAP mostra che la GAP fornisce un residuo di Arg al sito attivo di Ras. v. 1.2 gsartor 2012 M04 - Trasduzione del segnale II 55 A valle di Ras Ras attivata porta alla attivazione di Raf e quindi della cascata delle chinasi che porta all attivazione della Mitogen Activated Protein Kinase (MAPK) È una kinasi in serina/treonina che può essere traslocata nel nucleo e fosforila i fattori di trascrizione di proteine coinvolte nella gestione del ciclo cellulare; v. 1.2 gsartor 2012 M04 - Trasduzione del segnale II 56

29 A valle di Ras v. 1.2 gsartor 2012 M04 - Trasduzione del segnale II 57 Raf (Rapidly Accelerated Fibrosarcoma) Una volta attivata Raf-1 può fosforilare due proteinkinasi: MEK1 e MEK2 che attivano le serina/treonina protein-kinasi ERK1 e ERK2 Le ERK attivate hanno un effetto pleitropico (differenti effetti in differenti cellule) a secondo della linea cellulare interessata. v. 1.2 gsartor 2012 M04 - Trasduzione del segnale II 58

30 La fosforilazione di Tyr e Thr attiva MAP kinasi v. 1.2 gsartor 2012 M04 - Trasduzione del segnale II 59 Proteine scaffold v. 1.2 gsartor 2012 M04 - Trasduzione del segnale II 60

32 v. 1.2 gsartor 2012 M04 - Trasduzione del segnale II 63 ErbB ErbB1 EGFR ErbB2 Ligandi non identificati Forma eterodimeri con tutti ErbB3 Assente l attività tirosin kinasica ErbB4 v. 1.2 gsartor 2012 M04 - Trasduzione del segnale II 64

33 Dimeri Il legame del ligando: EGF-like o NRG (neuregulina) alla porzione extracellulare di ErbB porta alla formazione di dimeri. Sia ErbB3 (privo di attività tirosinkinasica) o ErbB4 possono formare omodimeri Quando ErbB2 è sovraespresso di formano preferibilmente eterodimeri Gli omodimeri sono inattivi (ErbB3) o hanno bassa attività mentre gli eterodimeri con ErbB2 possiedono un attività che prolunga il segnale a valle Apparentemente gli omodimeri ErbB2 generano un segnale intracellulare più debole degli eterodimeri che lo contengono. v. 1.2 gsartor 2012 M04 - Trasduzione del segnale II 65 v. 1.2 gsartor 2012 M04 - Trasduzione del segnale II 66

35 Internalizzazione Vi è una possibile localizzazione nucleare dei RTK; In un caso, ErbB-4, il recettore è processato da due proteasi di membrana per produrre un dominio citoplasmatico solubile che include il dominio tirosinkinasico; Il frammento generato è presente nel nucleo ; Tre altri RTK sono stati trovati nel nucleo in assenza di processi proteolitici; In alcuni casi la localizzazione nucleare dipende dal legame con il growth-factor. v. 1.2 gsartor 2012 M04 - Trasduzione del segnale II v. 1.2 gsartor 2012 M04 - Trasduzione del segnale II 70

36 v. 1.2 gsartor 2012 M04 - Trasduzione del segnale II 71 Crediti e autorizzazioni all utilizzo Questo materiale è stato assemblato da informazioni raccolte dai seguenti testi: CHAMPE Pamela, HARVEY Richard, FERRIER Denise R. LE BASI DELLA BIOCHIMICA [ISBN ] Zanichelli NELSON David L., COX Michael M. I PRINCIPI DI BIOCHIMICA DI LEHNINGER - Zanichelli GARRETT Reginald H., GRISHAM Charles M. BIOCHIMICA con aspetti molecolari della Biologia cellulare - Zanichelli VOET Donald, VOET Judith G, PRATT Charlotte W FONDAMENTI DI BIOCHIMICA [ISBN ] Zanichelli Harvey Lodish, A Berk, C.A. Kaiser, M. Krieger, M.P. Scott, A. Bretscher, P. Ploegh, Paul Matsudaira - Biologia molecolare della cellula - Zanichelli E dalla consultazione di svariate risorse in rete, tra le quali: Kegg: Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes Brenda: Protein Data Bank: Rensselaer Polytechnic Institute: Questo ed altro materiale può essere reperito a partire da: oppure da gsartor.org/ Il materiale di questa presentazione è di libero uso per didattica e ricerca e può essere usato senza limitazione, purché venga riconosciuto l autore usando questa frase: Materiale ottenuto dal Prof. Giorgio Sartor Università di Bologna a Ravenna Giorgio Sartor - giorgio.sartor@unibo.it v. 1.2 gsartor 2012 M04 - Trasduzione del segnale II 72