SEDE E CONTATTI. Direttore Struttura Complessa:Prof.ssa Barbara PASINI. Genetica Clinica. Laboratori di Genetica Molecolare

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1 afferente al Dipartimento Medicina di Laboratorio Direttore Struttura Complessa:Prof.ssa Barbara PASINI SEDE E CONTATTI - Presidio Molinette - Palazzina Ceppellini: Via Santena, Torino - Segreteria: Tel / Fax Studio Direttore: Tel Coordinatore: Tel genetica_medica@molinette.piemonte.it Genetica Clinica - Presidio Molinette - Palazzina Ceppellini: Via Santena, 5-2 piano Torino - Segreteria infermieristica: Tel Fax Studi Medici: Tel /4042/6680/ Fax Laboratori di Genetica Molecolare - Presidio Molinette - Palazzina Ceppellini: Via Santena, 5-1 piano Torino - Tel Fax Studi Dirigenti: /4480/ Presidio OIRM - Palazzina dei Laboratori: Piazza Polonia, 94-2 piano Torino - Tel /5580/ Fax Studi Dirigenti: tel /5649/5865 Laboratorio di Citogenetica 1 / 10

2 - Presidio OIRM - Palazzina dei Laboratori: Piazza Polonia, 94-2 piano Torino - Tel Fax Studi Dirigenti: Tel /5282 ORARI ATTIVITA' - Segreteria: dal lunedì al venerdì dalle ore 8.30 alle Laboratori: dal lunedì al venerdì dalle ore 8.30 alle Ambulatori di consulenza genetica: dal lunedì al venerdì dalle ore alle Ambulatorio di consulenza genetica pre-natale: dal lunedì al venerdì dalle ore 9.30 alle PRENOTAZIONI E PRELIEVI - Prenotazione consulenze genetiche: Tel. 011/ dal lunedì al venerdì dalle ore 9.00 alle 12.00, tramite fax al numero 011/ inviando impegnativa, dati anagrafici completi e recapito telefonico, tramite all'indirizzo genetica_medica@molinette.piemonte.it inviando impegnativa, dati anagrafici completi e recapito telefonico - Prenotazione consulenze genetiche oncologiche: Tel. 011/ dal lunedì al venerdì dalle ore 9.30 alle Prenotazione esame cromosomico post-natale: il Medico Specialista richiedente il cariotipo costituzionale è tenuto alla compilazione del Modulo richiesta esame cromosomico post-natale e del Modulo per la raccolta del consenso informato da fornire al paziente insieme all'impegnativa (vedi Documenti e Moduli). Per la prenotazione dell'esame, rivolgersi al Centro Prelievi del presidio OIRM-Sant'Anna con le seguenti modalità: - di persona: dal lunedì al venerdì dalle ore alle ore presso la Segreteria del Centro Prelievi Unificato con impegnativa, referto di consulenza genetica o visita specialistica e moduli suddetti - via fax: inviando impegnativa e pdf dichiarazione di atto notorio, referto di consulenza genetica o visita specialistica e moduli suddetti, al numero 011/ via inviando impegnativa e pdf dichiarazione di atto notorio, referto di consulenza genetica o visita specialistica e moduli suddetti, all'indirizzo segreterialab@cittadellasalute.to.it - Prelievi di sangue per l'esecuzione di test genetici molecolari: il Medico Specialista 2 / 10

3 richiedente esami di genetica molecolare è tenuto alla compilazione del Modulo richiesta analisi molecolari e del Modulo per la raccolta del consenso informato da fornire al paziente insieme all'impegnativa (vedi Documenti e Moduli). Per l'esecuzione del prelievo, presentarsi senza prenotazione con impegnativa, referto di consulenza genetica o visita specialistica e moduli suddetti al Centro Prelievi del presidio OIRM-Sant'Anna (piazza Polonia, 94) dal lunedì al venerdì dalle ore 7.30 alle ore per gli adulti e dalle ore 8.00 alle ore 9.30 per i bambini (tel. 011/ ). Se il prelievo di sangue è finalizzato alla sola esecuzione di test genetici non serve il digiuno. EQUIPE - Referente per la qualità Monica Grosso - Medici Carlo Arduino, Guido Casalis Cavalchini, Enrico Grosso, Roberta Marinoni, Valeria G. Naretto, Barbara Pasini, Andrea Zonta - Biologi e biotecnologi Valentina Asnaghi, Marco Barberis, Gabriella Benetton, Mariagrazia Bonissone, Alfredo Brusco, Anna Carbone, Gaetana D'Alessandro, Cristina De Leo, Patrizia Dentelli, Eleonora Di Gregorio, Monica Grosso, Caterina Mari, Giuseppe Matullo, Elisa Menegatti, Paola Ogliara, Roberto Piva, Francesca Restivo, Luca Sbaiz, Sabina Siviero, Francesca Vignolo Lutati - Coordinatori Pia Bibbò (presidio Molinette), Marina Peretto (ad interim, presidio OIRM) - Personale tecnico Helga Buoso, Eva Colombo, Fabiola Conte, Francesca D'Alessio, Marina Duvant, Giorgio Ferrio, Marina Ferrone, Debora Fiorito, Irene Impoco, Marilena Innocentin, Cinzia Luciano, Enrica P. Maurici, Donatella Mediate, Chiara Michielotto, Patrizia Pappi, Maria Carmela Paradiso, Valentina Rinaldi, Stella Russo, Paola Salmin, Monica Salvego, Annamaria Sedita, Tiziana Scopacasa, Flavia Talarico - Personale infermieristico e amministrativo 3 / 10

4 Giuseppina Campagnola, Anna Rosa Carriero Messere, Lidia De Feo, Maria Francesca Ruta, Antonietta Viscogliosi - Antonio Delia, Celestina Garzella ATTIVITA' E INFORMAZIONI GENERALI La SC Genetica Medica U è Centro Regionale di Riferimento per la Genetica Medica (DGR n del ), la branca della Medicina dedicata alla diagnosi e alla gestione clinica delle "malattie genetiche" ovvero le patologie causate in modo esclusivo o parziale da un difetto del patrimonio genetico. Ad oggi sono note più di malattie genetiche che comprendono: - le malattie cromosomiche causate da un difetto del numero o della struttura dei cromosomi: il test di laboratorio per la diagnosi delle malattie cromosomiche è l'analisi del cariotipo o esame cromosomico - le malattie genomiche causate da micro-delezioni o micro-duplicazioni di una regione del genoma solitamente comprendente diversi geni: nella maggior parte delle malattie genomiche, il difetto genetico non è riconoscibile con l'esame cromosomico e il test di laboratorio indicato per la loro diagnosi è l'array-cgh (ibridazione genomica comparativa su array) o l'esame FISH (ibridazione fluorescente in situ su preparato cromosomico) nei rari casi in cui la diagnosi clinica induce a sospettare una specifica micro-delezione - le malattie geniche causate dalla mutazione di uno specifico gene: le analisi di genetica molecolare disponibili per la diagnosi delle malattie geniche sono molteplici e dipendono dal tipo di mutazione da ricercare e dal numero di geni che possono causare la malattia oggetto di indagine - le malattie da difetto di imprinting, condizioni spesso caratterizzate da iper- o ipo-sviluppo e sono dovute ad un difetto di controllo dell'espressione genica; alcuni geni sono infatti "funzionanti" solo se trasmessi dal padre o dalla madre: le analisi di genetica molecolare disponibili per la diagnosi dei difetti di imprinting comprendono i cosiddetti test della metilazione e lo studio di polimorfismi per verificare il contributo in geni trasmesso da ciascun genitore. Ogni anno viene scoperta la causa genetica di circa 300 nuove malattie: qualsiasi percorso diagnostico in genetica medica deve quindi basarsi sui seguenti principi: 1. definizione del quesito clinico: la richiesta di una consulenza genetica o di qualsiasi test di laboratorio non può prescindere dalla definizione chiara e circostanziata del quadro clinico del paziente, del sospetto diagnostico che si intende verificare o della malattia genetica presente in famiglia per la quale il soggetto è a rischio 2. appropriatezza: qualsiasi prestazione erogata dal Sistema Sanitario Nazionale deve 4 / 10

5 essere richiesta quando è necessaria al percorso di diagnosi e cura della persona; tutti i test genetici sono sottoposti a precisi criteri di appropriatezza prescrittiva volti a tutelare il diritto del cittadino ad accedere alle prestazioni di cui ha bisogno e il diritto della comunità ad un razionale utilizzo delle risorse: ogni richiesta impropria o inutile sottrae risorse e ritarda l'esecuzione di una prestazione appropriata e importante per un'altra persona 3. aggiornamento e innovazione: la rapidità con la quale evolvono le conoscenze e le tecnologie diagnostiche nell'ambito della genetica medica rende necessario un processo continuo di aggiornamento del personale e delle procedure a tutela della qualità del servizio. Ambulatori di consulenza genetica La consulenza genetica è un atto medico volto alla diagnosi di una malattia genetica e/o alla definizione di un rischio clinico. La diagnosi può essere formulata sulla base delle manifestazioni cliniche del paziente e/o attraverso la prescrizione di un test genetico e la successiva interpretazione del risultato. Durante la consulenza genetica vengono inoltre fornite tutte le informazioni necessarie alla comprensione del percorso diagnostico, delle stime di rischio, delle modalità di prevenzione o di gestione clinica della malattia. Viene inoltre fornito adeguato supporto al percorso decisionale e all'integrazione delle informazioni ricevute nel proprio vissuto e nel contesto familiare. La Struttura esegue tra le e le consulenze genetiche all'anno. Requisiti per la consulenza genetica: - sospetto clinico di una malattia genetica o stato di rischio documentato in base alla storia familiare - impegnativa del Medico Specialista o del Medico di Medicina generale per "consulenza genetica" (codice del catalogo regionale "prima visita di laboratorio") - documentazione clinica completa inerente il quesito posto dal Medico richiedente Ambulatori L'attività ambulatoriale di consulenza genetica viene svolta, previa prenotazione, nella sede indicata dall'operatore tra le seguenti: - Consulenze genetiche dell'adulto, del bambino e oncologiche: stanze 2 e 6 della Breast Unit (Via Cherasco, 23-2 piano - sede San Lazzaro del presidio Molinette, dalle ore alle ore 17.00, Tel ) 5 / 10

6 - Consulenze genetiche pre-natali: stanza dedicata del Centro di Ecografia Ostetrica/Ginecologica e Diagnosi prenatale (Via Ventimiglia, 1-2 piano - presidio Sant'Anna, dalle ore 9.30 alle ore 12.30, Tel ) - Consulenze genetiche per Fibrosi Cistica: presso SC Pneumologia Pediatrica / Centro Regionale Fibrosi Cistica del presidio OIRM (Via Zuretti, 23-2 piano - percorso d, dalle ore 9,30 alle ore 12,30, Tel ) - Consulenze genetiche post-test: stanze 2 e 6 della Breast Unit (Via Cherasco, 23-2 piano), stanza 6 di sinistra degli Ambulatori Centrali (Corso Bramante, 88 - piano terra del presidio Molinette, Tel ) Laboratorio di citogenetica Il laboratorio esegue esami cromosomici (o cariotipi) all'anno per la diagnosi dei difetti del numero o della struttura dei cromosomi in epoca post-natale (prelievo di sangue venoso periferico, più raramente biopsie cutanee o di altri tessuti) e pre-natale (liquido amniotico, biopsia di villi coriali della placenta, più raramente sangue fetale). L'esame cromosomico è di regola eseguito con bandeggio G (colorante Giemsa) e necessita di cellule vive propagate in coltura: per questa ragione l'esame cromosomico post-natale è soggetto a prenotazione e il prelievo viene eseguito nei primi giorni della settimana. Il laboratorio esegue inoltre colture cellulari per la successiva esecuzione di test molecolari, il test per la diagnosi delle cosiddette malattie da fragilità cromosomica (DEB test) ed esami di citogenetica molecolare mediante tecnica FISH (ibridazione fluorescente in situ). Il laboratorio dispone di un'ampia gamma di sonde per l'esecuzione di esami FISH su nuclei in interfase (sonde alfoidi per i cromosomi 21, 18, 13, X e Y) o su preparati cromosomici: sonde alfoidi, painting e sub-telomeriche per tutti i cromosomi umani, sonde cosmidiche per la diagnosi delle 8 micro-delezioni genomiche meno rare: 22q11.2 (Sindrome di DiGeorge tipo 1), 10p14 (Sindrome di DiGeorge tipo 2), 7q11.23 (Sindrome di Williams), 15q11-q13 (Sindrome di Prader-Willi / Angelman), 17p13.3 (Sindrome di Miller-Dieker), 17p11.2 (Sindrome di Smith-Magenis), 1p36 (Delezione subtelomerica del braccio corto del cr. 1), Xp22.3 (Ittiosi X-linked), la rilevazione dell'sry (Sex-determining Region - Yp11.3) nonché sonde custom per la risoluzione di quesiti clinici particolari. Laboratori di genetica molecolare I laboratori eseguono un'ampia gamma di esami molecolari volti alla diagnosi di malattie geniche, di condizioni di rischio e test rapidi per la determinazione di aneuploidie cromosomiche. Le modalità di esecuzione dei test genetici dipendono dal tipo di mutazione da ricercare (sconosciuta o già nota in famiglia, puntiforme o strutturale), dalle caratteristiche della malattia oggetto di indagine (genica, genomica, da difetto di imprinting) e dal suo livello di eterogeneità genetica (mutazioni in geni diversi possono causare la stessa malattia o malattie simili). Le metodiche di analisi utilizzate dai laboratori di genetica molecolare comprendono: 6 / 10

7 - il sequenziamento del DNA con metodo Sanger e di nuova generazione (NGS - Next Generation Sequencing) applicato all'analisi di oltre 170 geni responsabili di malattie del bambino e dell'adulto tra le quali la Fibrosi Cistica, le forme più frequenti di sordità, displasie scheletriche, craniosinostosi, malattie auto-infiammatorie, atassie, leucoencefalopatie, neuropatie ed altre malattie neurologiche e del neuro-sviluppo (incluse SLA e malattia di Parkinson), iperplasie surrenaliche congenite, sindromi rare e le principali forme di predisposizione allo sviluppo di tumori della mammella, dell'ovaio, del tratto gastro-enterico, del rene, melanomi, tumori endocrini, pediatrici e la Sclerosi Tuberosa - le analisi di frammento e le repeat-primed PCR per la ricerca di espansioni di ripetizioni instabili causa della sindrome dell'x-fragile, corea di Huntington, Distrofia Miotonica tipo 1, distrofia muscolare oculo-faringea, epilessia mioclonica, atrofia muscolare bulbare e delle principali forme di atassia dominante e recessiva (SCA1, 2, 3, 6, 7, 8, 10, 12, 17, 36, DRPLA, atassia di Friedreich) - la discriminazione allelica per la determinazione rapida delle trisomie dei cromosomi 21, 13, 18, X e Y su campioni di liquido amniotico, biopsie di villi coriali e materiale abortivo (in quest'ultimo caso l'esame comprende anche le aneuploidie dei cromosomi 15, 16 e 22) - le analisi di polimorfismi e il test di metilazione per la diagnosi dei difetti di imprinting (disomie uniparentali dei cromosomi 6, 7, 11, 14, 15 e 16 e sindromi di Prader-Willi e Angelman) - le tecniche di riconoscimento delle micro-delezioni / micro-duplicazioni in tutto il genoma (array-cgh) o in geni specifici (MLPA, real-time PCR e long-range PCR utilizzate per la diagnosi della sindrome di DiGeorge tipo 1 e 2, distrofia muscolare di Duchenne e Becker, atrofia muscolare spinale, sindrome di Pelizaeus-Merzbacher, neuropatie CMT1A e HNPP, l'ittiosi X-linked e la ricerca delle micro-delezioni del cromosoma Y (AZF-A, B, C ed SRY) - le tecniche per la ricerca di varianti e mutazioni ricorrenti (reverse dot blot e real-time PCR) applicate alla diagnosi delle talassemie, delle emocromatosi, del rischio trombofilico e del rischio di tossicità da 5-fluoro-uracile e di sanguinamento da warfarin. DOCUMENTI E MODULI Modulo per la raccolta del consenso informato 7 / 10

8 Consenso al trattamento dei dati genetici e del campione biologico (pdf KB) Laboratorio di Citogenetica Catalogo: Analisi citogenetiche, test per aneuploidie cromosomiche, disomie uniparentali e ricerca di micro-delezioni, microduplicazioni (pdf - 64 KB) Modulo richiesta Esame cromosomico post-natale-deb test-fish (pdf KB) Modulo richiesta Esame cromosomico pre-natale-qf-pcr-ospedali esterni (pdf KB) Scheda informativa: Esame cromosomico post-natale- Prenotazione/Accettazione/Appropriatezza (pdf KB) Istruzioni: Esame cromosomico pre-natale - Invio campioni LA-CVS ospedali esterni (pdf KB) Laboratori di Genetica molecolare Catalogo: Test molecolari - Laboratori Molinette e OIRM (pdf KB) Catalogo: Test molecolari per Trombofilie, Emocromatosi e di farmacogenetica (agg. il 18/06/ 2018) (pdf - 54 KB 8 / 10

9 ) Note al catalogo prestazioni SC Genetica Medica U e moduli richiesta analisi Laboratorio Molinette (pdf KB) Informazioni generali sui test genetici nel disturbo dello spettro autistico (pdf KB) Laboratorio presidio OIRM Modulo richiesta Analisi molecolari Laboratorio OIRM (pdf KB) Laboratorio presidio Molinette Modulo richiesta Analisi molecolari Sangue Periferico - Laboratorio Molinette (pdf KB) Modulo richiesta Analisi molecolari DNA Estratto - Laboratorio Molinette (pdf KB) Modulo richiesta Analisi molecolari prenatali Laboratorio Molinette (pdf KB) Genetica oncologica Questionario per la raccolta della familiarità oncologica (pdf KB) 9 / 10

10 Informazioni generali sull'analisi dei geni BRCA1-BRCA2 (pdf KB) Modulo richiesta analisi geni BRCA1-BRCA2 - Laboratorio Molinette (pdf KB) LA RICERCA Il Personale universitario e ospedaliero della SC Genetica Medica U partecipa attivamente a progetti di ricerca locali, nazionali ed internazionali volti all'identificazione di nuove malattie genetiche, al miglioramento della diagnosi e gestione clinica di malattie già note e allo sviluppo di sistemi e percorsi diagnostici. Tra le attività in evidenza: - progetto TESEO (Traguardi di Eccellenza nelle Scienze mediche Esplorando le Omiche - Progetto MIUR Dipartimenti di eccellenza del Dipartimento di Scienze Mediche dell'università di Torino) - progetto NeuroWES (Identificazione di nuovi geni associati a forme ereditarie monogeniche di anomalie del neurosviluppo) - Sperimentazione del prototipo NIPT VANADIS per lo screening prenatale non-invasivo delle trisomie dei cromosomi 21 (sindrome di Down), 18 e / 10