CARTA DEI SERVIZI. UOS Dipartimentale di Genetica Medica

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1 CARTA DEI SERVIZI UOS Dipartimentale di Genetica Medica Consulente supervisore: Dott. Antonio Novelli Responsabile UOSD di Genetica Medica: Dott. Giuseppe Barrano Equipe Medica Specialisti in Genetica Medica: Dott.ssa Maria Grazia Di Gregorio, Dott.ssa Carlotta Vaccari. Equipe di Laboratorio: Dott.ssa Daria Darelli, Dott. Gianluca Di Giacomo, Dott.ssa Simona Grotta,,Dott.ssa Katia Petrilli, Dott.ssa Sara Morara, Dott.ssa Orchi Amarilli, Dott.ssa Diana Postorivo, Dott.ssa Lucia Prima, Dott.ssa Ilaria Zito e Roberta Carotti. Segreteria/Ammnistrazione: Sig.ra Paola Cercaci telefono: Descrizione: L'attività dell' UOSD di Genetica Medica è rivolta alle persone che presentano o sono a rischio di sviluppare una malattia genetica, e alle loro famiglie, per aiutarle a definire la diagnosi della malattia, offrendo ai pazienti la consulenza genetica e provvedendo a tutte le attività di supporto per i pazienti stessi e per i loro familiari, ivi compresa l'indicazione e la gestione dei test genetici. Come raggiungerci: Sede: Ospedale San Pietro Fatebenefratelli Referente: Dott. Giuseppe Barrano Via Cassia 600, 00189, Roma 3 Piano Scala C Telefono: Fax: barrano.giuseppe@fbfrm.it in macchina: uscita 3 per SS2/Cassia verso Roma Centro (Grande Raccordo Anulare) direzione Roma centro, per circa 3 Km. L'Ospedale si trova sulla vostra sinistra, Via Cassia 600. Con i mezzi pubblici: LINEE AUTOBUS n 201 da Piazza Mancini n 301 da Grottarossa Raggiungere Piazza Mancini dalla Stazione Termini: Prendere la linea METRO A (BATTISTINI) per 4 fermate METRO A ogni 3 minuti Scendere alla fermata Flaminio Recarsi alla fermata FLAMINIO Prendere la linea 2 (MANCINI) per 7 fermate 2 ogni 5 min Scendere alla fermata MANCINI

2 MISSIONE E ATTIVITA' svolta presso L'UOS Dipartimentale di GENETICA MEDICA L'attività della UOSD di Genetica Medica è rivolta alle persone, bambini o adulti, le cui condizioni sono o potrebbero essere collegate ad alterazioni genetiche, oppure ai loro familiari. Tutti i familiari dei pazienti coinvolti possono essere interessati a conoscere meglio le caratteristiche di tali condizioni, sia sul versante clinico e della qualità di vita, che sul versante genetico e del rischio di essere a loro volta affetti o di poter trasmettere la malattia ai figli. L'attività della genetica clinica e della consulenza genetica consiste nell'aiutare ad individuare i percorsi diagnostici, e, ove possibile, a comprendere l'origine della alterazione genetica, le modalità di trasmissione, l'eventuale rischio di ricorrenza, il carico clinico e le risorse di sostegno, e le possibilità di diagnosi prenatale. Tale attività si svolge in stretta collaborazione con i laboratori di citogenetica e di genetica molecolare (secondo le linee-guida per le Attività di Genetica Medica definite nella Conferenza Stato-Regioni del 17/07/2004). L UOSD di Genetica Medica collabora quotidianamente con i reparti di Ginecologia ed Ostetricia, TIN, Neonatologia e Pediatria, svolge la propria attività in maniera trasversale con il Reparto di Patologia Clinica dell Ospedale. La UOSD di Genetica Medica è costituita dal Laboratorio di Citogenetica, Citogenetica Molecolare, Genetica Molecolare e dall'ambulatorio di Consulenza Genetica e Genetica Clinica. Ogni test genetico prenatale e postnatale è sempre preceduto da una consulenza genetica (per accertarne l indicazione, precisare i confini entro i quali svolgere gli esami, fornire al paziente o alla coppia informazioni sui rischi, sull affidabilità e sui limiti delle tecniche di indagine. Quando necessario viene offerta la possibilità di una consulenza genetica in seguito ai risultati del test, come strumento per l interpretazione dei risultati, per stabilire le correlazioni cliniche tra genotipo e fenotipo e l'eventuale rischio per future gravidanze, per chiarire il peso della patologia sulla qualità di vita del paziente o del nascituro. Per la tutela dell utente, si ispira ai principi sanciti dalla Direttiva del Presidente del Consiglio dei Ministri del 27 gennaio 1994, dal Decreto del Presidente del Consiglio dei Ministri del 19 maggio 1995 ed alla Carta europea dei diritti del malato del 15 novembre 2002, relativi a: Uguaglianza: la dignità della persona deve essere rispettata in tutti i momenti del vissuto quotidiano, senza distinzione di sesso, razza, lingua, nazionalità, religione, opinioni politiche o condizione economica. Imparzialità: devono essere evitati atteggiamenti di parzialità e ingiustizia nei confronti degli utenti, i quali hanno diritto a trattamenti obiettivi. Continuità: il servizio offerto viene svolto in maniera regolare e continuativa, tranne nei casi di astensione che rientrino negli aspetti organizzativi del servizio o siano regolati o annunciati ufficialmente da leggi. Diritto di scelta: gli utenti sono liberi di scegliere sul territorio nazionale la struttura sanitaria a cui preferiscono accedere. Partecipazione: deve essere assicurata l informazione, la personalizzazione e l umanizzazione del servizio tutelando l utente nell'accesso alle informazioni che lo riguardano. Efficienza ed efficacia: i servizi, gli interventi e le attività svolte devono raggiungere risultati ottimali utilizzando al meglio le risorse con il minimo di sprechi e duplicazioni.

3 MODALITÀ DI ACCESSO ALLE PRESTAZIONI La CONSULENZA GENETICA e le ANALISI GENETICHE DI LABORATORIO si effettuano previo appuntamento telefonico presso il servizio dell dal lun al ven dalle 9,30 alle 13,00 al numero tel , i tempi di attesa per l'appuntamento sono inferiori ai 30 gg. AMBULATORIO DI CONSULENZA GENETICA E GENETICA CLINICA L obiettivo del centro è di soddisfare con la massima efficienza e professionalità le esigenze del paziente. La sezione di Genetica Clinica si occupa della consulenza genetica a favore dei pazienti che accedono all Istituto, ai quali viene offerto e garantito un servizio altamente professionale da parte del personale medico specialista in genetica medica. Vengono svolti diversi tipi di consulenza, secondo la diversa esigenza del paziente. Possono rivolgersi all Istituto persone che necessitano di una consulenza genetica clinica oppure pazienti che hanno già ricevuto la prescrizione di un test genetico da un altro specialista o dal proprio medico curante e quindi necessitano di una consulenza specifica, legata al test genetico da eseguire. Secondo quanto previsto dalle linee guida per le attività di Genetica Medica, ogni test genetico è preceduto da una consulenza collegata al test stesso, dove il paziente acquisite le informazioni fornite durante il colloquio di consulenza genetica pre-test, in particolare in merito allo scopo del prelievo, l utilita ed i limiti del test genetico, le caratteristiche dei possibili risultati e le eventuali implicazioni dei risultati per il paziente e per l'intero nucleo familiare, autorizza l'analisi mediante la sottoscrizione di un consenso informato. L indagine fornisce informazioni unicamente sulla patologia o sul rischio di patologia per cui è stata richiesta l analisi. Inoltre il test genetico puo richiedere non solo l analisi del paziente, ma anche dei suoi familiari, o nello stesso momento o in periodi diversi previo acquisizione del consenso informato da parte di quest'ultimi. Il paziente ha la facoltà di interrompere in qualsiasi momento le procedure di indagine. Il paziente ha la facoltà di opporsi al trattamento dei dati genetici per motivi legittimi. Nell'ambito della consulenza pre-test vengono identificate anche l'eventuali analisi in urgenza. Vengono considerate URGENTI le analisi di: Cariotipo standard e/o FISH e/o QF-PCR su liquido e/o villi coriali di gravidanze che hanno superato la 19^ settimana gestazionale o di gravidanze a rischio, secondo le indicazioni dello specialista di riferimento; Cariotipo standard e/o FISH su sangue periferico di neonati o di coppie con gravidanza in corso a rischio di patologie cromosomiche; Array-CGH in epoca prenatale o su sangue periferico di neonati (se richiesto dallo specialista); Conferma dei dati di array-cgh su paziente e familiari qualora l approfondimento dell analisi con tecniche indipendenti venisse considerato importante dallo specialista nel percorso diagnostico del paziente. Analisi di genetica molecolare su pazienti con indicazione per sospetto clinico, familiarità o sospetto ecografico. Per le suddette analisi in urgenza, vengono rispettati le procedure analitiche d'analisi, ma hanno la precedenza di processazione sugli altri e rientrano nei tempi di analisi in urgenza secondo quando previsto dalle lineee guida della SIGU (Società Italiana di Genetica Umana) ed indicate nell'elenco delle prestazioni. Consulenze disponibili: consulenza genetica legata al test: consulenza pre test consulenza post test consulenza di genetica clinica Quando necessario, viene fornita al paziente una consulenza genetica scritta, legata al colloquio o al risultato del test eseguito. Per effettuare le analisi genetiche è necessario acquisire un campione di sangue periferico non a digiuno, che verra utilizzato per estrarre il DNA necessario per l analisi molecolare e/o per la messa in coltura di cellule per le analisi citogenetiche. I rischi connessi al prelievo di sangue periferico sono di minima entità: i più frequenti sono la comparsa di ecchimosi nel punto di prelievo e la lipotimia (svenimento) legata in genere piu all emotivita del soggetto che non al prelievo. Solo molto raramente si possono verificare effetti collaterali (ematomi, piccole lesioni o infezioni locali).

4 CITOGENETICA L'analisi Citogenetica ha lo scopo d'identificare sindromi legate ad aberrazioni cromosomiche numeriche e strutturali. Infatti l'analisi del cariotipo permette di evidenziare eventuali anomalie cromosomiche, sia numeriche (quali trisomie, monosomie), che strutturali (traslocazioni, delezioni ed inversioni). Il materiale genetico, il DNA, si presenta durante l accrescimento cellulare, come un ammasso disorganizzato non analizzabile. Al momento della divisione, esso si condensa in strutture ordinate, i cromosomi, che sono invece analizzabili. Per la determinazione del cariotipo, le cellule vengono bloccate in un momento particolare della divisione: la metafase. In metafase infatti, i cromosomi si presentano come strutture ben definite, facilmente individuabili e riconoscibili al microscopio. Dopo aver bloccato le cellule in metafase i cromosomi vengono colorati con sostanze che si fissano selettivamente a determinate zone cromosomiche, dando luogo ad un caratteristico aspetto a bande: bande Q, G o R secondo la tecnica di colorazione utilizzata. La fase successiva comprende l osservazione al microscopio: i cromosomi vengono contati, fotografati mediante telecamere adattate al microscopio ed analizzati. I cromosomi vengono poi appaiati a due a due in base alle dimensioni, alla posizione del centromero (una strozzatura del cromosoma) e al bandeggio. Si arriva così alla determinazione del cariotipo. Con questo esame è possibile diagnosticare la Sindrome di Down o Trisomia 21 che è l anomalia cromosomica più diffusa (1 su 700). Con l esame del cariotipo fetale è anche possibile diagnosticare la presenza di anomalie dei cromosomi sessuali come la Sindrome di Klinefelter (1-2 su 1000 neonati maschi) o la Sindrome di Turner (0,1 su 1000 neonati femmine) e di altre sindromi più rare, ma molto gravi, come la Sindrome di Edwards o di Patau. L esame strutturale e numerico dei cromosomi(si puo effettuare anche su linfociti di sangue periferico,fibroblasti ed altri tessuti) permette inoltre di rilevare la presenza di anomalie di struttura originate da rotture cromosomiche seguite da riarrangiamenti. Normative di Riferimento CITOGENETICA MOLECOLARE La citogenetica molecolare prevede lo studio di regioni cromosomiche specifiche attraverso tecniche che sfruttano il legame tra una sonda molecolare, (costituita da un frammento di DNA, specifico per la regione di interesse, marcato con composti fluorescenti), e la sequenza di DNA complementare del preparato che è stato fissato e montato su un vetrino portaoggetti. La tecnica dell Ibridazione in situ fluorescente (FISH) è la tecnica di citogenetica molecolare attualmente in uso nella SOD Diagnostica Genetica e viene applicata di routine all analisi del cariotipo, ma solo nei casi selezionati in base a specifici sospetti diagnostici o per approfondire determinate anomalie citogenetiche. L istruzione definisce le procedure per l ibridazione in situ basata su un legame selettivo di sonde di DNA, coniugate con coloranti fluorescenti (fluorocromi), che riconoscono sequenze complementari a quelle presenti su un cromosoma o su un segmento di cromosoma. La tecnica viene applicata in caso di sospetto clinico o quando i risultati ottenuti con le tecniche di citogenetica standard suggeriscano l opportunità di approfondimenti diagnostici. Si utizzano: Sonde centromeriche che permettono rapidamente di evidenziare anomalie numeriche dei cromosomi Sonde a sequenza unica che consentono di riconoscere specifici loci evidenziando delezioni e/o duplicazioni submicroscopiche di materiale cromosomico Sonde telomeriche, che identificano specificamente le regioni subtelomeriche presenti alle estremità dei cromosomi Sonde painting che colorano l intero cromosoma, utili per classificare anomalie cromosomiche strutturali. GENETICA MOLECOLARE Le indagini di genetica molecolare consistono nello studio del DNA le cui alterazioni possono essere correlate o responsabili di un particolare fenotipo; attraverso l analisi molecolare è quindi possibile individuare mutazioni del patrimonio genetico responsabili di malattie ereditarie e/o varianti polimorfiche. CENTRO DI RIFERIMENTO La UOSD di Genetica Medica eroga prestazioni in qualità di Centro di Riferimento facente parte della RETE DEI LABORATORI DI GENETICA MEDICA DELLA REGIONE LAZIO.

5 UBICAZIONE DEL LABORATORIO E DELL AMBULATORIO CONSULENZE Il LABORATORIO della UOSD di Genetica Medica è ubicato al 3 piano dell'edificio centrale scala C mentre l ambulatorio per le consulenze genetiche ed il prelievo è ubicato al 2 piano dell'edificio POLIAMBULATORIO/CUP all'interno dell'ambulatorio di Ginecologia ed Ostetricia. RITIRO DEI REFERTI ANALISI GENETICHE (amniocentesi, centesi, etc..) I tempi per i risultati diagnostici sono differenti in base al tipo di analisi richiesta e in base al tipo di tecnica eseguita (i tempi sono indicati nell'eventuale informativa specifica all'analisi richiesta e/o esplicitate in sede di consulenza pre-test) a partire dalla data di accettazione del campione (condizionata dall espletamento delle procedure amministrative). Eventuali tecniche e indagini aggiuntive che si rendessero necessarie per la valutazione di risultati complessi saranno comunicate e potranno richiedere tempi di refertazione più lunghi. I tempi di refertazione dell'amniocentesi o centesi da parte del laboratorio sono, nel 90% dei casi, disponibili dopo 21 giorni di calendario. La consegna dei risultati potrà essere effettuata esclusivamente nei giorni: MARTEDI dalle 14:00 alle 16:00 e GIOVEDI dalle 10:00 alle 13:00 presso il laboratorio dell'uosd di Genetica Medica, ubicato al terzo piano dell'edificio centrale scala C I referti e i dati acquisiti sono vincolati alle norme relative alla tutela della riservatezza dei dati sensibili (D.Lgs n 196) e vengono consegnate esclusivamente all'interessato o ad un suo delegato provvisto di delega e fotocopia del documento. Delega ritiro referti (Mod-040 Informativa ritiro refeti e delega) CONTROLLI E STANDARD DI QUALITÀ Il laboratorio partecipa annualmente ai controlli di qualità esterni dell Istituto Superiore di Sanità e ai controlli esterni di qualità Europei, CEQAS (Cytogenetic European Quality Assessment). Inoltre opera in riferimento agli standard qualitativi del disciplinare della Società Italiana di Genetica Umana (SIGU) finalizzati ad operare per un miglioramento continuo della qualità delle prestazioni offerte dalle Strutture di Genetica Medica a garanzia dei cittadini ed anche a tutela di tutti i professionisti del settore ed in riferimento alle linee guida e alle raccomandazione delle Società Scientifiche. L'UOSD di Genetica Medica è certificata secondo gli standard SANITA' SICURA: UNI EN ISO 9001:2015 n IT Sistema di gestione per la Qualità nei LABORATORI DI GENETICA MEDICA (Accreditamento SIGUCERT ai Disciplinari SIGU -Società Italiana di Genetica Umana) ed Certificato n 024 UFFICIO RELAZIONI CON IL PUBBLICO Presso l'ospedale San Pietro è attivo l'ufficio Relazioni con il Pubblico dove l'utente può vedere tutelato il proprio diritto ad esprimere eventuali opinioni della struttura ospedaliera. L'URP è situato al piano terra presso la Direzione Sanitaria. Orario di apertura: Dal lunedì al venerdì ore Telefono 06/ fax 06/ urp@fbfrm.it Sono competenze dell'urp 1. la tutela del cittadino mediante accoglienza, informazione e orientamento 2. la gestione delle segnalazioni, dei reclami, degli encomi 3. la risposta immediata all'utente o, nei casi più complessi, l'avvio dell'attività istruttoria ai fini della risposta stessa 4. i sondaggi e ricerche sulla qualità percepita 5. la promozione e lo sviluppo dell'immagine aziendale mediane dépliants informativi sui servizi e le prestazioni fornite dall'ospedale 6. la collaborazione con il tribunale dei diritti del malato e le associazioni di volontariato

6 ELENCO PRESTAZIONI Analisi Atrofia Muscolare Spinale (SMA) Disomia Uniparentale (UPD cr ) Distrofia muscolare di Duchenne e Backer Distrofia muscolare di Duchenne e Backer Campione Tipo Quantità Risposta (giorni lavorativi) Risposta Urgenza (giorni lavorativi) Procedura Analitica PRESTAZIONI GENETICA MOLECOLARE Valutazione della delezione dell'esone 7 del gene SMN1, associate alla patologia. Estrazione del DNA, Analisi semiquantitativa mediante fluorescente e rivelazione Studio della segregazione padre madre figlio dei marcatori genetici STR mediante estrazione del DNA fluorescente e genotipizzazione in sequenziatore automatico Analisi semiquantitativa dei 79 esoni del gene della distrofina (delezioni e duplicazioni). L esame si esegue sui maschi e sulle femmine con indicazione clinica al test, mediante estrazione del DNA, Analisi semiquantitativa amplificazione (PCR) Analisi delle più frequenti delezioni nel gene Distrofina solo sui maschi con indicazione al test. mediante estrazione del DNA, Note aggiuntive FIBROSI CISTICA (Analisi I livello) Analisi della segregazione familiare in diagnosi prenatale FIBROSI CISTICA (Analisi II livello) 21 gg. 15 gg. amplificazione e sequenziamento di nuova generazione.

7 Sordità Congenita CX26/30 Analisi della segregazione familiare in diagnosi prenatale Sordità Congenita CX26/30 Analisi di mutazioni dell'intera regione codificante del gene della Connessina 26 (CX26) e ricerca della mutazione D13S1830 della Connessina 30 X-Fragile o Sindrome di Martin-Bell (FRAXA) Valutazione dell espansione patologica di triplette nucleotidiche associate alla sindrome di Martin-Bell. Studio della stato di metilazione in presenza di mutazione completa nei maschi Microdelezioni Cromosoma Y (AZF) Analisi delle più frequenti microdelezioni del cromosoma Y solo sui maschi con indicazione al test, mediante estrazione del DNA, Analisi aneuploidie tramite QF-PCR (cromosomi 13,18,21,X,Y) 4ml 20mg 48h/72h 48h Studio dei marcatori genetici STR mediante estrazione del DNA fluorescente e genotipizzazione in sequenziatore automatico Acondroplasia in Emocromatosi (HFE) Fattori della COAGULAZIONE FII, FV, MTHFR 21 gg. 7 gg. BRCA1 e 2 60 gg. 21 gg. amplificazione e sequenziamento di nuova generazione.

8 PTPN11 in Analisi di mutazioni dell'intera regione codificante del gene PTPN11, mediante estrazione del DNA, e sequenziamento. PANNELLO RASOPATIE in, dei principali geni responsabili della cascata di RAS, mediante estrazione del DNA, e sequenziamento di nuova generazione. ANALISI MLPA per lo studio delle sindromi PWS/AS e sindrome di Beckwith- Wiedemann, studio delle delezioni telomeriche Esclusione contaminazione materna Cariotipo su in in 2 ml 48h/72h 48h PRESTAZIONI CITOGENETICA 15/20 ml 21 gg. La tempistica analisi condiziona ta dalla crescita cellulare. Valutazione della delezioni /duplicazioni regioni note, associate alla patologia in esame. Estrazione del DNA, Analisi semiquantitativa mediante fluorescente e rivelazione Studio della segregazione madre figlio dei marcatori genetici STR mediante estrazione del DNA fluorescente e genotipizzazione in sequenziatore automatico Studio dell'assetto cromosomico mediante allestimento della colture cellulari, allestimento dei preparati cromosomici bandeggio e analisi al microscopio. Cariotipo su Villo Coriali >25mg 21 gg. La tempistica analisi condizionat a dalla crescita cellulare. Studio dell'assetto cromosomico mediante allestimento della colture cellulari, allestimento dei preparati cromosomici bandeggio e analisi al microscopio. Cariotipo su periferico Eparina 28 gg. 10 gg. Studio dell'assetto cromosomico mediante allestimento della colture cellulari, allestimento dei preparati cromosomici bandeggio e analisi al microscopio. Cariotipo su Materiale Abortivo Cute fetale >25mg 28 gg. La tempistica analisi condizionat a dalla crescita cellulare. Studio dell'assetto cromosomico mediante allestimento della colture cellulari, allestimento dei preparati cromosomici bandeggio e analisi al microscopio. Cariotipo su Fibroblasti Cute fetale >25mg 28 gg. La tempistica analisi condizionat a dalla crescita cellulare. Studio dell'assetto cromosomico mediante allestimento della colture cellulari, allestimento dei preparati cromosomici bandeggio e analisi al microscopio.

9 PRESTAZIONI CITOGENETICA MOLECOLARE Array-CGH genomico (Array-based Comparative Genomic Hybridization) POST-NATALE in eparina sodica in 5ml 5ml 120 gg. 10 gg. Analisi dello sbilanciamento del numero di copie di sequenze genomiche su tutto il genoma. Mediante estrazione del DNA, digestione, marcatura ed ibridazione in situ fluorescente. Array-CGH genomico (Array-based Comparative Genomic Hybridization) PRE-NATALE 4ml 20mg Analisi dello sbilanciamento del numero di copie di sequenze genomiche su tutto il genoma. Mediante estrazione del DNA, digestione, marcatura ed ibridazione in situ fluorescente. Array-CGH array Targhettato Eparina Analisi dello sbilanciamento del numero di copie di sequenze genomiche su 43 regioni associate a sindromi da microdelezione/microduplicazion e note (risoluzione media Kb), le regioni subtelomeriche ti tutti i cromosomi (risoluzione media Kb). Ed infine l intero genoma ad una risoluzione di 3-4Mb. Mediante estrazione del DNA, digestione, marcatura ed ibridazione in situ fluorescente. FISH Eparina Studio delle microdelezioni e/o microduplicazioni di regioni cromosomiche note mediante allestimento della colture cellulari, allestimento dei preparati cromosomici ed ibridazione in situ Fluorescente. NIPT TEST PRENATALE NON INVASIVO. DNA FETALE SU SANGUE MATERNO 10ml 10 gg. 10 gg. identifica su un campione di sangue periferico, mediante sequenziamento di nuova generazione su DNA fetale presente nel sangue materno, la possibilità che il feto sia affetto dalle trisomie compatibili con la nascita, T21, T18, T13, ed eventualmente altre delezioni parziali cromosomiche rilevanti Inoltre, possono essere eseguiti test genetici per malattie rare, in collaborazione con la rete dei laboratori italiani ed europei, su indicazione, dopo visita di genetica clinica

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