Tempi di Refertazione * Metodo. Repeat primed PCR, test di metilazione e analisi di frammenti su Sequenziatore automatico. 30 gg (urgente 5 gg)

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1 Patologia Esame GENETICA MOLECOLARE PRENATALE E POSTNATALE Sindrome dell'x-fragile POI (Premature Ovarian Insufficiency) Sindrome dell'x fragile con tremore/atassia (FXTAS) Sindrome di Rett FMR1,espansione triplette e metilazione promotore MECP2, CDKL5 mutazioni puntiformi MECP2 delezioni/duplicazioni Tempi di Refertazione * (urgente Metodo Repeat primed PCR, test di metilazione e analisi di frammenti su Sequenziatore automatico Campione, etichetta con nome, cognome, data e luogo di nascita, residenza e codice fiscale 50ml + della madre terreno per raccolta + della madre Settore A.Fogli Sindrome di Prader-Willi Sindrome di Angelman SNRPN difetti di metilazione regione 15q11-13, delezione paterna cromosoma 15, disomia uniparentale materna SNRPN difetti di metilazione regione 15q11-13, delezione materna cromosoma 15, disomia uniparentale materna (urgente MS- MS- + 3 ml sangue EDTA genitori 50ml + dei genitori terreno per raccolta + dei genitori A. MS- A. + 3 ml sangue EDTA genitori (urgente 50ml + dei genitori terreno per raccolta + dei genitori UBE3A, mutazioni puntiformi A.Fogli

2 Sindrome di Silver-Russel Sindrome di Beckwith- Wiedemann Disomia uniparentale del cromosoma 14 Ritardo mentale alfa talassemia X- linked Sindrome di Williams cromosoma 7, disomia uniparentale cromosoma 11, disomia uniparentale regione 11p15, difetti di metilazione, microdelezioni/microduplicazioni cromosoma 11, disomia uniparentale regione 11p15, difetti di metilazione, microdelezioni/microduplicazioni CDKN1C, mutazioni puntiformi NSD1, mutazioni puntiformi cromosoma 14, disomia uniparentale ATRX, mutazioni puntiformi, delezioni/duplicazioni ATRX delezioni/duplicazioni (urgente (urgente + 3 ml sangue EDTA genitori 50ml + dei genitori terreno per raccolta + dei genitori A.Fogli MS- A. + 3 ml sangue EDTA genitori (urgente 50ml + dei genitori terreno per raccolta + dei genitori A.Fogli MS- A. A.Fogli + 3 ml sangue EDTA genitori 50ml + dei genitori terreno per raccolta + dei genitori A.Fogli e 1 provetta regione 7q11.23, delezione vacutainer da 3ml con EDTA di entrambi i genitori Elastina delezione A.

3 Sindrome di Di George Sindrome di Noonan Disturbo sindrome di Noonansimile con leucemia mielomonocitica giovanile Sindrome di Legius (sindrome NF1-simile) Sindrome Noonan-simile con capelli caduchi in fase anagen Sindrome neurofibromatosi- Noonan Sindrome di Leopard Sindrome cardiofaciocutanea Neurofibromatosi tipo 1 Sindrome di CHARGE Sindrome di Alagille regione 22q11.2 (urgente + 3 ml sangue EDTA genitori 50ml + dei genitori terreno per raccolta + dei genitori A.Fogli TBX, mutazioni puntiformi A.Fogli PTPN11, SOS1, RAF1, BRAF, 50ml + della madre KRAS, NRAS, SOS2, RIT1, LZTR1 (mutazioni terreno per raccolta + della madre CBL, mutazioni puntiformi SPRED, mutazioni puntiformi SHOC, mutazioni puntiformi NF, mutazioni puntiformi NF, delezioni/duplicazioni PTPN11, RAF1, BRAF (mutazioni BRAF, MAP2K1, MAP2K2, HRAS (mutazioni NF, mutazioni puntiformi NF, delezioni/duplicazioni CHD7, SEMA3E (mutazioni CHD7, delezioni/duplicazioni JAG1, NOTCH, mutazioni puntiformi JAG1, delezioni/duplicazioni A. A.

4 Sindrome di Hajdu Cheney NOTCH2 (esone 34, mutazioni A. Sindrome Cornelia de Lange Sindrome di Sotos Sindrome di Weaver Sindrome di Rieger Axenfeld- Rieger Distrofia miotonica di Steinert Distrofia muscolare di Duchenne- Becker Atrofia muscolare spinale (SMA) Atrofia Spinobulbare (SBMA) Sindrome di Kennedy Distrofie dei cingoli NIPBL, SMC1L1, RAD21, SMC3, HDAC8(mutazioni NIPBL delezioni/duplicazioni NSD1, NFIX mutazioni puntiformi NSD1delezioni/duplicazioni EZH2 mutazioni puntiformi FOXC1, PITX2 (mutazioni DMPK espansione triplette DMD,delezioni/duplicazioni Southern blot DMD, mutazioni puntiformi SMN1 (esoni 7 e 8), SMN2 (esoni 7 e 8): numero di copie AR espansione triplette esone 1 AR espansione triplette esone 1 LMNA, CAV3, CAPN3, DYSF, SGCG, SGCA, SGCB, TCAP, FKRP, ANO5, FKTN, GAA, DMD (mutazioni CAPN3, DYSF, SGCA, SGCB, SGCD, SGCG, FKRP, ANO5, GAA (urgente A. A. 50ml + della madre terreno per raccolta + della madre A. A. A.

5 Malattia di Pompe GAA mutazioni puntiformi GAA Distrofia facio scapolo omerale 2 SMCHD1 mutazioni puntiformi Distrofia muscolare di Emery- EMD mutazioni puntiformi Dreyfuss X-linked Distrofia muscolare di Emery- Dreyfuss 2 e 3 Paraparesi Spastica Ereditaria Distonia da torsione idiopatica (DYT1) Distonia DOPA-sensibile (DYT5) Distonia Mioclonica (DYT11) Neuropatia sensitivo-motoria di Charcot Marie Tooth (CMT1) Neuropatia ereditaria con predisposizione alle paralisi da compressione (HNPP) LMNA mutazioni puntiformi LMNA delezioni/duplicazioni SPG4, SPG3A, SPG7, SPG31, SPG10, SPG11, ZFYVE26, PLP1, RTN2, KIAA0196, NIPA1, AP5Z1, REEP2, FA2H, ERLIN1, KIF1A, CYP7B1 (mutazioni SPG4, SPG3A, SPG7, SPG gg DYT1 (c.907_909delgag mutazione nota) GCH1, mutazioni puntiformi GCH1,delezioni/duplicazioni SGCE, mutazioni puntiformi SGCE delezioni/duplicazioni regione 17p12 duplicazione PMP22, MPZ, CX32, LITAF, NEFL, EGR2, DNM2, PRX, LMNA, HSPB1, HSPB8 (mutazioni regione 17p12 delezione PMP22, MPZ, DNM2, HSPB8 (mutazioni A.Fogli A. A. A.

6 Charcot Marie Tooth tipo 2 (CMT2) Lissencefalia di tipo 1 (Sindrome di Miller-Dieker) Sclerosi laterale amiotrofica (SLA) Sindrome Peutz-Jeghers Encefalomiopatia mitocondriale Oftalmoplegia esterna progressiva Miopatie metaboliche MFN2, GDAP1, NEFL, LMNA, PRX, DNM2, HSPB1, HSPB8, GARS, FIG4, NDRG1(mutazioni LIS1, DCX (mutazioni SOD1, TARDBP, FUS, VCP, ATXN2, SPG11, OPTN, ANG, UBQLN2, TUBA4A, ALS2 (mutazioni C9ORF72 espansione intronica STK11 delezione POLG1, OPA1, C10ORF2, TYMP, POLG2, SLC25A4, TK2, MPV17, RRM2B, DGUOK (mutazioni POLG1, C10ORF2, POLG2, SLC25A4, TK2, MPV17, RRM2B, DGUOK, SUCLA2, SUCLG1 POLG1, OPA1, C10ORF2, TYMP, POLG2, SLC25A4, TK2, MPV17, RRM2B, DGUOK (mutazioni POLG1, C10ORF2, POLG2, SLC25A4, TK2, MPV17, RRM2B, DGUOK, SUCLA2, SUCLG1 CPT2, AMPD1, AGL, GBE1, PYGM, PFKM, PHKA1, PGK1, PNPLA2, ETFA, ETFB, ETFDH, GYS1, GYS2, LDHA, SLC22A5, ACADVL (mutazioni A.Fogli A.Fogli A. A.Fogli A.Fogli

7 Miopatie vacuolari LAMP2, MYH2, TRIM32, FHL1, LDB3, MYH7, FLNC, BAG3, GNE, ORAI1, CRYAB, DES, DNAJB6, CASQ1, STIM1, TNPO3, MYOT, TIA1 (mutazioni Ictus GLA, NOTCH3, FBN1, CTSA, LMNB1, CSF1R, TREX1, HTRA1, COL1A1, COL3A1, COL4A1, COL5A1, COL5A2, SLC2A10, TGFBR1, TGFBR2, SMAD3, TGFB2, APP (mutazioni 120 gg A.Fogli Atassie Parkinson POLG1, OPA1, SPG7, C10ORF2, FXN, ATM, APTX, SETX, TTPA, SACS, SIL1, NPC1, NPC2, ANO10, PHYH, CYP17A1 (mutazioni PARK2, PINK1, DJ1, SCNA, UCHL1 (mutazioni PARK2, PINK1, DJ1, SCNA 120 gg A.Fogli Sordità non sindromiche GJB2, GJB6, COCH, GJB3, POU3F4 (mutazioni e mutazione nota DNA mitocondriale A1555G GJB2, GJB6, mutazione nota GJB6 (del309kb) A.Fogli Sindrome di Pendred SLC26A4, FOXI1, KCNJ10 (mutazioni A.Fogli

8 Fibrosi cistica CFTR mutazioni note CFTR mutazioni puntiformi CFTR delezioni/duplicazioni (urgente ibridazione su striscia 50ml + della madre terreno per raccolta + della madre Discinesia ciliare primaria (compresa Sindrome di Karatgener) DNAH11, DNAH5, DNAI2, DNAI1, TXNDC3, CCDC39, CCDC40, RSPH9, RSPH4A, RSPH1, DNAL1, ARMC4, CCDC114, CCDC151, LRRC6, DNAAF1, DNAAF2, DNAAF3, DNAAF4, CCDC103, ZMYND10, HEATR2, SPAG1, C21ORF59, RSPH3, CCDC164, CCDC65, GAS8, CCNO, MCIDAS, HYDIN, TTC25, DNAJB13, PIHID3(mutazioni 120 gg Sindrome di Kallmann DNAH5, DNAI1 KAL1, FGFR1, PROK2, PROKR2, CHD7, GNRHR, GNRH1, FGF8, TAC3, KISS1, KISS1R, TACR3 (mutazioni A. Ipercalcemia Ipocalciurica Familiare (FHH) Neoplasia Endocrina Multipla tipo 1 Neoplasia Endocrina Multipla tipo 4 KAL1, FGFR1 CASR, AP2S1, GNA11 (mutazioni CASR MEN1 mutazioni puntiformi MEN1 delezioni/duplicazioni CDKN1B mutazioni puntiformi CDKN1B delezioni/duplicazioni A.Fogli A. A. A.

9 Sindrome di Denys-Drash WT1 mutazioni puntiformi Sindrome di Frasier WT1 mutazioni puntiformi Sindrome nefrosica di tipo 4 WT1 mutazioni puntiformi AR mutazioni puntiformi Sindrome di Morris AR delezioni 50ml + della madre terreno per raccolta + della madre 46,XY DSD e Disgenesia gonadica WT1, DHH, CBX2, MAP3K1, NR0B1, SOX9, AMH, AMHR2, HSD3B2, MAMLD1, POR, CYP17A1, AR, SRD5A2, HSD17B3, SRY, NR5A1, CYP17A1, BMP15 (mutazioni NR5A1, SOX9, WNT4, NR0B1 Disturbo dello sviluppo sessuale 46,XY da deficit di 5-alfareduttasi 2 Disturbi dello sviluppo sessuale 46,XY da deficit di 17-betaidrossisteroido deidrogenasi, tipo 3 Disturbo 46,XY dello sviluppo sessuale da deficit isolato di 17,20-liasi Disturbo 46,XY DSD da mutazioni del gene LHCGR SRD5A2, DMRT1, HS17B3, CYP17A1 SRD5A2 mutazioni puntiformi SRD5A2 delezioni/duplicazioni HSD17B3 mutazioni puntiformi HSD17B3 delezioni/duplicazioni CYP17A1 mutazioni puntiformi CYP17A1 delezioni/duplicazioni LHCGR mutazioni puntiformi

10 Ipoplasia delle cellule di Leydig tipo 1 e 2 Iperplasia surrenale congenita (CAH) Infertilità Emocromatosi ereditaria Malattia di Fabry LHCGR mutazioni puntiformi CYP21A2 mutazioni puntiformi CYP21A2 delezioni/duplicazioni HSD3B2, CYP17A1, STAR, POR, CYP11B1(mutazioni Microdelezioni regione AZF del cromosoma Y FSHR, IRS1 (mutazioni note ) HFE, TRF2, FPN1 (mutazioni note ) GLA mutazioni puntiformi GLA delezioni/duplicazioni ibridazione su striscia Sindrome di Gilbert UGT1A1 ripetizioni promotore Diabete non insulino-dipendente giovanile di tipo 2 (MODY2) Diabete non insulino-dipendente giovanile di tipo 3 (MODY3) Ipotiroidismo non autoimmune GCK mutazioni puntiformi GCK delezioni/duplicazioni HNF1alfa, mutazioni puntiformi HNF1alfa, delezioni/duplicazioni TSHR mutazioni puntiformi Ittiosi recessiva legata all'x STS delezioni/duplicazioni Suscettibilità alla dermatite FLG (varianti R501X e c.2284del atopica ) Linfedema FLT4, FOXC2 mutazioni puntiformi Sindrome blefarofimosi-ptosiepicanto inverso FOXL2 delezioni/duplicazioni FOXL2 mutazioni puntiformi Ipofosfatasia (Malattia di Rathburn) ALPL mutazioni puntiformi Odontoipofosfatasia A. A.Fogli A. A.Fogli A.Fogli A. A.Fogli

11 Acondroplasia Ipocondroplasia Displasia tanatoforica Sindrome di Apert Malattia di Crouzon Sindrome di Pfeiffer Rachitismo ipofosfatemico Calcinosi tumorale familiare Malattia di Dent, tipo 1 Rachitismo vitamina D dipendente tipo I Rachitismo vitamina D dipendente tipo II Ipercalcemia infantile Bassa statura idiopatica e Sindrome di Leri Weill Osteogenesi imperfetta Labiopalatoschisi FGFR3 mutazioni puntiformi e mutazioni note FGFR2 (esoni 8 e 10): mutazioni puntiformi e mutazioni note FGFR2, FGFR1(mutazioni puntiformi e mutazioni note) PHEX, FGF23, DMP1, ENPP1, SLC34A3, KL, GALNT3, CLCN5 (mutazioni PHEX, FGF23 FGF23 mutazioni puntiformi FGF23 CLCN5 mutazioni puntiformi CYP27B1 mutazioni puntiformi VDR mutazioni puntiformi CYP24A1 mutazioni puntiformi SHOX, GHR, IGFR1 (mutazioni SHOX e regione PAR COL1A1, COL1A2 (mutazioni COL1A1, COL1A2 IRF6 mutazioni puntiformi A. A. A. A. A. A.

12 Trombofilia ereditaria (fattori di rischio patologie cardiovascolari) Mutazioni note: Fattore V (G1691A, H1299R), Protrombina (G20210A), MTHFR (C677T, A1298C), Fattore XIII (V34L), β- fibrinogeno (-455G>A), PAI-1 (4G/5G), HPA1 (a/b), ACE (INS/DEL), APOE, CBS (844ins68 I/D), AGT (M235T), ATR-1 (A1166C) Cardiopatie ipertrofiche (CMI) MYH7, MYL2 (mutazioni note ) ibridazione su striscia A. Analisi del chimerismo post trapianto (urgente 7 gg) Analisi di contaminazione materna 3 gg Ricerca rapida aneuploidie cromosomiche, QF PCR 3 gg Deficit di diidropirimidina DPYD mutazioni puntiformi deidrogenasi Tossicità del 5-fluorouracile DPYD mutazioni note VHL mutazioni puntiformi Sindrome di Von Hippel-Lindau VHL delezioni/duplicazioni GENETICA ONCOLOGICA GERMINALE SDHD, SDHB, SDHC, VHL,SDHA, SDHAF2 (mutazioni Paragangliomi/Feocromocitoma SDHD, SDHB, SDHC, VHL 50ml + della madre terreno per raccolta + della madre 50ml + della madre terreno per raccolta + della madre A.Fogli A.Fogli A.Fogli A. A. A.

13 Tumori ereditari della mammella e dell'ovaio (I livello) Tumori ereditari della mammella e dell'ovaio (II livello) Tumori ereditari della mammella e dell'ovaio (III livello) Sindrome di Lynch (HNPCC) Poliposi adenomatosa familiare (FAP e AFAP) Sindromi poliposiche amartomatose Sindrome di Peutz-Jeghers BRCA1, BRCA2(mutazioni BRCA1, BRCA2 BRCA1, BRCA2 (analisi RNA ) PALB2, CDH1, PTEN, TP53 (mutazioni P53, CDH1, PTEN, PALB2 ATM, BARD1, CHEK2, STK11, RAD51C, RAD51D, BRIP1(mutazioni MLH1, MSH2, MSH6 (mutazioni MLH1, MSH2, MSH6, EPCAM APC, MUTYH, POLE, POLD1, NTHL1(mutazioni APC, MUTYH STK11, SMAD4, BMPR1A, PTEN (mutazioni STK11mutazioni puntiformi STK11delezioni/duplicazioni (urgente ) RT-PCR e sequenziamento (Sanger) 2 x sangue in 2 provette Pax gene 2 x 2 x 2 x 2 x 2 x 2 x Poliposi serrate RNF43 mutazioni puntiformi 2 x Sindrome di Gardner Sindrome di Turcot APC mutazioni puntiformi APC delezioni/duplicazioni APC mutazioni puntiformi APC delezioni/duplicazioni K. M.A. Caligo M.A. Caligo K. M.A. Caligo M. Tancredi M.A. Caligo 2 x 2 x

14 Sindrome da suscettibilità familiare al blastoma DICER1 mutazioni puntiformi pleuropolmonare (Dicer1 K. Syndrome) PTEN mutazioni puntiformi M. Sindrome di Cowden 2 x Tancredi PTEN delezioni/duplicazioni Tumore di Wilms (nefroblastoma) WT1 mutazioni puntiformi 2 x P53 mutazioni puntiformi Sindrome di Li-Fraumeni 2 x P53 delezioni/duplicazioni K. M. Sindrome del nevo displasico P16, CDK4 (mutazioni Tancredi 2 x (melanoma ereditario) M.A. Caligo GENETICA ONCOLOGICA SOMATICA Tumori colon sporadici Tumori cerebrali sporadici BRAF, KRAS, NRAS (mutazioni note ) MSI instabilità microsatellitare MGMT metilazione promotore IDH1, IDH2(mutazioni note ) MGMT metilazione promotore Codelezione 1p19q 10 gg 10 gg Real-Time PCR pirosequenziamento pirosequenziamento pirosequenziamento Melanoma sporadico BRAF, NRAS (mutazioni note ) 10 gg Real-Time PCR E' possibile richiedere l'analisi di un singolo gene contenuto nei pannelli con un tempo di refertazione di 45 gg *I tempi di refertazione possono subire variazioni se necessari approfondimenti sul paziente o sui familiari Blocchetto o 5 sezioni del preparato istologico in bianco della neoplasia Blocchetto o 5 sezioni del preparato istologico in bianco della neoplasia Blocchetto o 5 sezioni del preparato istologico in bianco della neoplasia K. K. K. K. K. Conservazione e consegna Conservazione a TEMPERATURA AMBIENTE e consegna in laboratorio nell'orario di accettazione: lun-ven ; Laboratorio Genetica Molecolare, Edificio 57 ex stabulario, Ospedale Santa Chiara