venerdì 4 maggio 2012

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La biologia molecolare: dalla teoria alla pratica 9

Un lungo percorso

11

La doppia elica del DNA 1952 - Rosalind Franklin e Maurice Wilkins studiano la molecola del DNA con la diffrattometria ai raggi X 1953 - James Watson e Francis Crick Pubblicano su Nature la scoperta della struttura del DNA 1962 Crick, Watson e Wilkins vincono il premio Nobel

Caratteristiche del DNA Ogni persona ha un caratteristico e unico profilo di DNA (salvo per i gemelli omozigoti). Il DNA di ogni persona è lo stesso in ogni cellula. Il profilo del DNA di un individuo rimane lo stesso durante tutta la vita. Metà del vostro DNA deriva da vostra madre e metà da vostro padre.

Tetranucleotide: AAAG AAAG AAAG AAAG Trinucleotide: CTT CTT CTT CTT CTT Dinucleotide: AG AG AG AG AG AG 15

D7S280, uno dei 13 CODIS STR loci genetici Si trova nel 7 cromosoma umano; la sequenza di DNA di un allele rappresentativo di questo locus è mostrata qui sotto 1 aatttttgta ttttttttag agacggggtt tcaccatgtt ggtcaggctg actatggagt 61 tattttaagg ttaatatata taaagggtat gatagaacac ttgtcatagt ttagaacgaa 121 ctaacgatag atagatagat agatagatag atagatagat agatagatag atagacagat 181 tgatagtttt tttttatctc actaaatagt ctatagtaaa catttaatta ccaatatttg 241 gtgcaattct gtcaatgagg ataaatgtgg aatcgttata attcttaaga atatatattc 301 cctctgagtt tttgatacct cagattttaa ggcc 1 aattgagcnc aggagtttaa gaccagcctg ggtaacacag tgagacccct gtctctaca 61 aaaaatacaa aaatnagttg ggcatggtgg cacgtgcctg tagtctcagc tacttgcagg 121 gctgaggcag gaggagttct tgagcccaga aggttaaggc tgcagtgagc catgttcatg 181 ccactgcact tcactctgag tgacaaattg agaccttgtc tcagaaagaa agaaagaaag 241 aaagaaagaa agaaagaaag aaagaaagaa agaaagaaag aaaaagagag ggaaagaaag 301 agaaanagna aanaaatagt agcaactgtt attgtaagac atctccacac accagagaag 361 ttaattttaa ttttaacatg ttaagaacag agagaagcca acatgtccac cttaggctga 421 cggtttgttt atttgtgttg ttgctggtag tcgggtttgt tatttttaaa gtagcttatc 481 caatacttca ttaacaattt cagtaagtta tttcatcttt caacataaat acgnacaagg 541 atttcttctg gtcaagacca aactaatatt agtccatagt aggagctaat actatcacat 601 ttactaagta ttctatttgc aatttgactg tagcccatag ccttttgtcg gctaaagtga 661 gcttaatgct gatcgactct agag

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I componenti della PCR DNA dntps Primers PCR buffer + MgCl 2 Taq DNA polymerase

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DNA profiling: Tecnica di identificazione personale (PCR STR-Multiplex) La tecnica consiste nell amplificazione simultanea di 13-15 loci STR (short tandem repeats), altamente polimorfici e indipendenti, i cui alleli non abbiano dimensioni sovrapponibili

Fasi del DNA-profiling 1. Estrazione del DNA! Test di paternità: mucosa orale! Identificazione colpevoli: sangue, saliva (bicchiere, mozzicone, ecc.), sperma, capello 2. PCR! Kit commerciali con primers marcati con fluorocromi diversi! Marcatori interni di lunghezza (ladder allelico) 3. Elettroforesi 4. Elaborazione automatizzata dell immagine

Federal Bureau of Investigation Sistema CODIS ( Combined DNA Index System) Utilizza13 loci STR + Locus sesso. Ogni locus STR è identificato da una sigla (D3S1179, D8S1179, ecc.) e di ciascuno è nota la frequenza dei rispettivi alleli nella popolazione. I dati sono stati inseriti nella Banca dati nazionale degli Stati Uniti. Laboratori di tutto il mondo contribuiscono ai dati sulle frequenze degli alleli nelle rispettive popolazioni.

CODIS: Combined DNA Index System TPOX D3S1358 D5S818 D8S1179 TH01 VWA D2S1338 FGA CSF1PO D7S820 D13S317 Penta E D16S539 D19S433 D18S51 D21S11 AMEL Sex-typing AMEL Penta D

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