SETTIMANA LUN MAR MER GIO VEN

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1 SETTIMANA S:Introduzione al seq. Solanacee 18-S:Introduzione al seq. Drupacee INTRODUZIONE GIORNATEGENOMICHE 06-S: Sequenziamento Solanacee 09-S: Sequenziamento Pomacee 12-S: Sequenziamento vite 19-S: Sequenziamento Drupacee S:Sequenziamento Graminacee 07-S: Sequenziamento Solanacee 10-S: Sequenziamento Pomacee 13-S: Sequenziamento vite 20-S: Sequenziamento Drupacee S:Sequenziamento Graminacee 08-S: Sequenziamento Solanacee 11-S: Sequenziamento Pomacee 14-S: Sequenziamento vite 21-S: Sequenziamento Drupacee 22-Conclusioni sul seq. genomi veg, S:Sequenziamento Graminacee 15- S: Sequenziamento olivo S:Sequenziamento Graminacee 16- S: Sequenziamento olivo S: Sequenziamento olivo SETTIMANA VACANZE CARNEVALE VACANZE CARNEVALE VACANZE CARNEVALE 01-Introduzione NGS 07-Introduzione NGS Introduzione NGS 08-Introduzione NGS Introduzione NGS 09-Introduzione NGS Introduzione NGS 10-Introduzione NGS Introduzione NGS 11-Introduzione NGS Introduzione NGS 12-Introduzione NGS SETTIMANA Genome Sequencer Illumina 07-Genome Sequencer Illumina 01-Tecnologie SOLID 07-Tecnologie SOLID Genome Sequencer Illumina 08-Genome Sequencer Illumina 02-Tecnologie SOLID 08-Tecnologie SOLID Genome Sequencer Illumina 09-Genome Sequencer Illumina 03-Tecnologie SOLID 09-Tecnologie SOLID Genome Sequencer Illumina 10-Genome Sequencer Illumina 04-Tecnologie SOLID 10-Tecnologie SOLID Genome Sequencer Illumina 11-Genome Sequencer Illumina 05-Tecnologie SOLID 11-Tecnologie SOLID Genome Sequencer Illumina 12-Genome Sequencer Illumina 06-Tecnologie SOLID 12-Tecnologie SOLID SETTIMANA Consultaz. ed uso seq. genom. ann. 04-Consultaz. ed uso seq. genom. ann. 07-Consultaz. ed uso seq. genom. ann. 10-Consultaz. ed uso seq. genom. ann. 13-Consultaz. ed uso seq. genom. ann Consultaz. ed uso seq. genom. ann. 05-Consultaz. ed uso seq. genom. ann. 08-Consultaz. ed uso seq. genom. ann. 11-Consultaz. ed uso seq. genom. ann. 14-Consultaz. ed uso seq. genom. ann Consultaz. ed uso seq. genom. ann. 06-Consultaz. ed uso seq. genom. ann. 09-Consultaz. ed uso seq. genom. ann. 12-Consultaz. ed uso seq. genom. ann Fondamenti assemblaggio seq, 04-Fondamenti assemblaggio seq, 07-Fondamenti assemblaggio seq, 10-Fondamenti assemblaggio seq, Fondamenti assemblaggio seq, 05-Fondamenti assemblaggio seq, 08-Fondamenti assemblaggio seq, 11-Fondamenti assemblaggio seq, Fondamenti assemblaggio seq, 06-Fondamenti assemblaggio seq, 09-Fondamenti assemblaggio seq, 12-Fondamenti assemblaggio seq, SETTIMANA

2 Genomica comparativa 07-Genomica comparativa 13-Genomica comparativa 01-Genome Sequencer 454/Roche Genomica comparativa 08-Genomica comparativa 14-Genomica comparativa 02-Genome Sequencer 454/Roche Genomica comparativa 09-Genomica comparativa 15-Genomica comparativa 03-Genome Sequencer 454/Roche Genomica comparativa 10-Genomica comparativa 16-Genomica comparativa 04-Genome Sequencer 454/Roche Genomica comparativa 11-Genomica comparativa 17-Genomica comparativa 05-Genome Sequencer 454/Roche Genomica comparativa 12-Genomica comparativa 18-Genomica comparativa 06-Genome Sequencer 454/Roche SETTIMANA Genomica comparativa 34-Genomica comparativa Genomica comparativa 25-Genomica comparativa 32-Genomica comparativa 35-Genomica comparativa Genomica comparativa 26-Genomica comparativa 33-Genomica comparativa 36-Genomica comparativa Genomica comparativa 27-Genomica comparativa 01-Fondamenti mappaggio reads 05-Fondamenti mappaggio reads Genomica comparativa 28-Genomica comparativa 02-Fondamenti mappaggio reads 06-Fondamenti mappaggio reads Genomica comparativa 29-Genomica comparativa 03-Fondamenti mappaggio reads 07-Fondamenti mappaggio reads Genomica comparativa 30-Genomica comparativa 04-Fondamenti mappaggio reads 08-Fondamenti mappaggio reads SETTIMANA Annotazione sequenze 11-Annotazione sequenze Annotazione sequenze 12-Annotazione sequenze Annotazione sequenze 13-Annotazione sequenze 09-Fondamenti mappaggio reads 12-Fondamenti mappaggio reads 07-Annotazione sequenze 14-Annotazione sequenze Fondamenti mappaggio reads 13-Fondamenti mappaggio reads 04-Annotazione sequenze 08-Annotazione sequenze Fondamenti mappaggio reads 14-Fondamenti mappaggio reads 05-Annotazione sequenze 09-Annotazione sequenze Annotazione sequenze 10-Annotazione sequenze SETTIMANA INIZIO VACANZE PASQUA RNA-Seq RNA-Seq RNA-Seq RNA-Seq RNA-Seq RNA-Seq SETTIMANA FINE VACANZE PASQUA 10-11

3 SETTIMANA FESTA DEL LAVORO Impiego microarray 04-Impiego microarray 07-Impiego microarray Impiego microarray 05-Impiego microarray 08-Impiego microarray Impiego microarray 06-Impiego microarray 09-Impiego microarray RNA-Seq 10-RNA-Seq 13-RNA-Seq RNA-Seq 11-RNA-Seq 14-RNA-Seq RNA-Seq 12-RNA-Seq 15-RNA-Seq SETTIMANA Impiego microarray 13-Impiego microarray 16-Impiego microarray 19-Impiego microarray 22-Impiego microarray Impiego microarray 14-Impiego microarray 17-Impiego microarray 20-Impiego microarray 23-Impiego microarray Impiego microarray 15-Impiego microarray 18-Impiego microarray 21-Impiego microarray 24-Impiego microarray RNA-Seq 19-RNA-Seq 22-RNA-Seq 25-RNA-Seq 28-RNA-Seq RNA-Seq 20-RNA-Seq 23-RNA-Seq 26-RNA-Seq 29-RNA-Seq RNA-Seq 21-RNA-Seq 24-RNA-Seq 27-RNA-Seq 30-RNA-Seq SETTIMANA RNA-Seq RNA-Seq RNA-Seq 31-RNA-Seq 35-RNA-Seq 39-RNA-Seq RNA-Seq 36-RNA-Seq 40-RNA-Seq 43-RNA-Seq RNA-Seq 37-RNA-Seq 41-RNA-Seq 44-RNA-Seq RNA-Seq 38-RNA-Seq 42-RNA-Seq 45-RNA-Seq SETTIMANA Sequenziamento NGS si srna 08-Sequenziamento NGS si srna Sequenziamento NGS si srna 09-Sequenziamento NGS si srna 15-Sequenziamento NGS si srna Sequenziamento NGS si srna 10-Sequenziamento NGS si srna 16-Sequenziamento NGS si srna Sequenziamento NGS si srna 11-Sequenziamento NGS si srna 17-Sequenziamento NGS si srna

4 Sequenziamento NGS si srna 12-Sequenziamento NGS si srna 18-Sequenziamento NGS si srna Sequenziamento NGS si srna 13-Sequenziamento NGS si srna 19-Sequenziamento NGS si srna Sequenziamento NGS si srna 14-Sequenziamento NGS si srna 20-Sequenziamento NGS si srna SETTIMANA ChiP-Seq per regol. trascriz. 07-ChiP-Seq per regol. trascriz. 13-ChiP-Seq per regol. trascriz. 18-ChiP-Seq per regol. trascriz ChiP-Seq per regol. trascriz. 08-ChiP-Seq per regol. trascriz. 14-ChiP-Seq per regol. trascriz. 19-ChiP-Seq per regol. trascriz ChiP-Seq per regol. trascriz. 09-ChiP-Seq per regol. trascriz. 15-ChiP-Seq per regol. trascriz. 20-ChiP-Seq per regol. trascriz ChiP-Seq per regol. trascriz. 10-ChiP-Seq per regol. trascriz. 16-ChiP-Seq per regol. trascriz ChiP-Seq per regol. trascriz. 11-ChiP-Seq per regol. trascriz. 17-ChiP-Seq per regol. trascriz ChiP-Seq per regol. trascriz. 12-ChiP-Seq per regol. trascriz. SETTIMANA FESTA DELLA REPUBBLICA Risequenziamento genomi 05-Risequenziamento genomi 09-Risequenziamento genomi 13-Risequenziamento genomi Risequenziamento genomi 06-Risequenziamento genomi 10-Risequenziamento genomi 14-Risequenziamento genomi Risequenziamento genomi 07-Risequenziamento genomi 11-Risequenziamento genomi 15-Risequenziamento genomi 04-Risequenziamento genomi 08-Risequenziamento genomi 12-Risequenziamento genomi 16-Risequenziamento genomi SETTIMANA Ricerca polimorfismi 07-Ricerca polimorfismi 13-Ricerca polimorfismi 19-Ricerca polimorfismi 25-Ricerca polimorfismi Ricerca polimorfismi 08-Ricerca polimorfismi 14-Ricerca polimorfismi 20-Ricerca polimorfismi 26-Ricerca polimorfismi Ricerca polimorfismi 09-Ricerca polimorfismi 15-Ricerca polimorfismi 21-Ricerca polimorfismi 27-Ricerca polimorfismi 28-Ricerca polimorfismi Ricerca polimorfismi 10-Ricerca polimorfismi 16-Ricerca polimorfismi 22-Ricerca polimorfismi Ricerca polimorfismi 11-Ricerca polimorfismi 17-Ricerca polimorfismi 23-Ricerca polimorfismi Ricerca polimorfismi 12-Ricerca polimorfismi 18-Ricerca polimorfismi 24-Ricerca polimorfismi SETTIMANA Sequenziamento genoma organelli 05-Sequenziamento genoma organelli 09-Sequenziamento genoma organelli 13-Sequenziamento genoma organelli 02-Sequenziamento genoma organelli 06-Sequenziamento genoma organelli 10-Sequenziamento genoma organelli 14-Sequenziamento genoma organelli Sequenziamento genoma organelli 07-Sequenziamento genoma organelli 11-Sequenziamento genoma organelli 15-Sequenziamento genoma organelli

5 Sequenziamento genoma organelli 08-Sequenziamento genoma organelli 12-Sequenziamento genoma organelli 16-Sequenziamento genoma organelli SETTIMANA Sequenziamento genoma organelli 01-Proteogenomica 01-Bioinf. in post-genomica Sequenziamento genoma organelli 02-Proteogenomica 02 Bioinf. in post-genomica Sequenziamento genoma organelli 03-Proteogenomica 03-Bioinf. in post-genomica 20-Sequenziamento genoma organelli Proteogenomica Proteogenomica Proteogenomica SETTIMANA Bioinf. in post-genomica 07-Bioinf. in post-genomica 10-Bioinf. in post-genomica 16-Proteogenomica Bioinf. in post-genomica 08-Bioinf. in post-genomica 11-Bioinf. in post-genomica 17-Proteogenomica Bioinf. in post-genomica 09-Bioinf. in post-genomica 12-Bioinf. in post-genomica 18-Proteogenomica Proteogenomica 10-Proteogenomica 13-Proteogenomica 19-Proteogenomica Proteogenomica 11-Proteogenomica 14-Proteogenomica 20-Proteogenomica Proteogenomica 12-Proteogenomica 15-Proteogenomica SETTIMANA Bioinf. in post-genomica 19-Bioinf. in post-genomica 25-Bioinf. in post-genomica Bioinf. in post-genomica 20-Bioinf. in post-genomica 26-Bioinf. in post-genomica Bioinf. in post-genomica 21-Bioinf. in post-genomica 27-Bioinf. in post-genomica Bioinf. in post-genomica 22-Bioinf. in post-genomica 28-Bioinf. in post-genomica Bioinf. in post-genomica 23-Bioinf. in post-genomica 29-Bioinf. in post-genomica Bioinf. in post-genomica 24-Bioinf. in post-genomica 30-Bioinf. in post-genomica SETTIMANA Bioinf. in post-genomica 37-Bioinf. in post-genomica 01-S01:Prosp. genom. post-genom 07-S03:Prosp. genom. post-genom Bioinf. in post-genomica 38-Bioinf. in post-genomica 02-S01:Prosp. genom. post-genom 08-S03:Prosp. genom. post-genom Bioinf. in post-genomica 39-Bioinf. in post-genomica 03-S01:Prosp. genom. post-genom 09-S03:Prosp. genom. post-genom 04-S02:Prosp. genom. post-genom 10-S04:Prosp. genom. post-genom Bioinf. in post-genomica Bioinf. in post-genomica 05-S02:Prosp. genom. post-genom 11-S04:Prosp. genom. post-genom Bioinf. in post-genomica 06-S02:Prosp. genom. post-genom 12-S04:Prosp. genom. post-genom

6 B.01.a Overview sui progetti di sequenziamento delle piante d'interesse agrario: (a) cereali ORE 21 B.09 Consultazione ed utilizzo di sequenze genomiche annotate Traini Alessandra B.01.b Overview sui progetti di sequenziamento delle piante d'interesse agrario: (b) solanacee B.01.c Overview sui progetti di sequenziamento delle piante d'interesse agrario: (d) pomacee B.01.d Overview sui progetti di sequenziamento delle piante d'interesse agrario: (e) drupacee 6 seminari da 3 ore ciascuno + 3 ore "miste": Luigi Cattivelli (graminacee), Giovanni Giuliano B.10, Genomica comparativa: analisi di famiglie (solanacee), Riccardo Velasco (pomacee), geniche Massimo Delledonne (vite), Simone Scalabrin (olivo), Ignazio Verde (drupacee). B.11 RNA-Seq: Assemblaggio ed annotazione de novo di trascrittomi e digital gene expression profiling B.12 Impiego dei microarray per lo studio dell' espressione genica Sanseverino Walter D'Agostino Nunzio Ferrarini Alberto B.01.e Overview sui progetti di sequenziamento delle piante d'interesse agrario: (f) agrumi B.13 Sequenziamento NGS di small RNA ed analisi dei dati Faccioli Primetta B.01.f Overview sui progetti di sequenziamento delle piante d'interesse agrario: (c) vite B.14 ChiP-Seq applicato allo studio della regolazione della trascrizione Matarazzo Maria Rosaria B.01.g Overview sui progetti di sequenziamento delle piante d'interesse agrario: (f) olivo B.02.a Introduzione agli approcci NGS: basi teoriche e risultati attuali, le innovazioni e le prospettive ORE B.03 Genome Sequencer 454/Roche Gaetano Perrotta B.15 Risequenziamento di genomi e risequenziamento targeted di geni candidati mediante tecnologie NGS B.16. Ricerca di polimorfismi (SNPs/indels) da dati NGS Delledonne Massimo Sanseverino Walter B.04 Genome Sequencer Illumina ORE 12 Angela Cordella B.17 Sequenziamento mediante tecnologie NGS ed B.05 Tecnologia SOLiD ORE 12 Giovanna Marchese Scotti Nunzia annotazione del DNA mitocondriale e plastidico B.06 Fondamentali sull'assemblaggio delle sequenze B.18 Proteogenomica Caterino Marianna B.07 Fondamentali sul mappaggio delle reads lungo un genoma di riferimento D'Agostino Nunzio B.19 La bioinformatica nell'era post-genomica: strumenti e banche l'analisi e l' integrazione di dati 'omici' Boccia Angelo

7 D'Agostino Nunzio B.08 Annotazione di sequenze genomiche: dalla sequenza alla funzione B.20.a Prospettive della genomica e postgenomica nella genetica agraria

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