GENETICA E RISORSE ITTICHE
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- Dionisia Giusti
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1 GIORNATA SATELLITE SAPIEXPO FOOD SAFETY AND QUALITY: SICUREZZA E QUALITA DEL CIBO GENETICA E RISORSE ITTICHE MILANA V., ROSSI A.R., SOLA L. Sapienza Università di Roma Piano strategico Ufficio di supporto al Nucleo di Valutazione Strategica Roma, 3 Luglio 2014
2 2 2 tonnellate tonnellate Genetica e Risorse Ittiche PESCA E ACQUACOLTURA IN ITALIA (FAO FishStatJ, 2014) 264 x 10 Italia 3 Mar Mediterraneo 682 x x x 10 3 Principali specie pescate in Italia (> tonnellate): Engraulis encrasicolus (alice o acciuga) anno Principali specie allevate in Italia (> tonnellate): Sparus aurata (orata) anno Sardina pilchardus (sardina) Merluccius merluccius (nasello) Dicentrarchus labrax (spigola o branzino)
3 tonnellate tonnellate Genetica e Risorse Ittiche ACQUACOLTURA IN ITALIA (FAO FishStatJ, 2014) ORATA Italia Estensiva: valli e lagune Intensiva: vasche a terra gabbie a mare anno anno SPIGOLA Italia anno anno ALTRE SPECIE MARINE ALLEVATE : ombrine, cefali e saraghi Impianti di allevamento Avannotterie riproduttori autoctoni o alloctoni flusso di avannotti dalle avannotterie agli allevamenti grande rimescolamento di giovanili di diversa origine geografica
4 Genetica e Risorse Ittiche CONTRIBUTI DELLA CARATTERIZZAZIONE GENETICA PESCA Individuazione di popolazioni geneticamente divergenti e potenziale correlazione con gli stock di pesca Analisi di processi demografici storici e recenti Tracciabilità del pescato e frodi ACQUACOLTURA Origine dei riproduttori Attribuzione paternità Inquinamento genetico: introduzione volontaria o accidentale in ambienti naturali e semiconfinati rotture delle gabbie e fughe rilascio gameti in gabbia
5 Genetica e Risorse Ittiche STRUMENTI DELLA GENETICA: MARCATORI MOLECOLARI 1 Estrazione DNA 2 Amplificazione PCR 3 Sequenziamento DNA nucleare (microsatelliti, AFLP, SNP, etc) diploide, ereditarietà mendeliana ricombinazione genica vari tassi di sostituzione nucleotidica genetica di popolazione, flusso genico, fingerprinting NCBI ( FISH-BOL (www. fishbol.org) DNA mitocondriale (mtdna, cyt b, COI, CR) aploide, ereditarietà materna no ricombinazione genetica elevati tassi di sostituzione nucleotidica genetica di popolazione, eventi demografici storici COI DNA barcoding
6 Genetica e Risorse Ittiche Fragolino Pagellus erythrinus Nasello Merluccius merluccius Latterino Atherina boyeri Barracuda mediterraneo Sphyraena viridensis Cernia Epinephelus marginatus Orata Sparus aurata Cefalo mazzone Mugil cephalus
7 Genetica e Risorse Ittiche CASI DI STUDIO: PESCA Individuazione di popolazioni geneticamente divergenti e potenziale correlazione con gli stock di pesca Analisi di processi demografici storici e recenti Numerosi siti di campionamenti lungo le coste italiane Marcatori molecolari: mtdna e microsatelliti Latterino (Atherina boyeri) Specie lagunare Bassa dispersione mtdna e microsatelliti: suddivisione in popolazioni geneticamente divergenti Nasello (Merluccius merluccius) Specie demersali Alta dispersione mtdna: bassa diversità aplotipica colonizzazione recente del Mediterraneo No suddivisione Fragolino (Pagellus erythrinus) mtdna: alta diversità aplotipica (3 aplogruppi) isolamento, divergenza, contatto secondario confermata dai microsatelliti SNP: SUDDIVISIONE (Milano et al. 2013), ma popolazioni diverse da stock di pesca
8 Genetica e Risorse Ittiche CONTRIBUTI DELLA CARATTERIZZAZIONE GENETICA PESCA Individuazione di popolazioni geneticamente divergenti e potenziale correlazione con gli stock di pesca Analisi di processi demografici storici e recenti Tracciabilità del pescato e frodi INTERSPECIE INTRASPECIE specie di minor pregio vendute sotto il nome di specie pregiate (verdesca - pesce spada; pangasio cernia) Italia: 32% di contraffazione del prodotto ittico processato (Filonzi et al. 2010) Irlanda, merluzzo bianco, Gadus morhua: 28.4% di contraffazione del prodotto ittico processato, 70% di contraffazione del prodotto affumicato (Mariani et al. 2012)
9 Genetica e Risorse Ittiche CONTRIBUTI DELLA CARATTERIZZAZIONE GENETICA PESCA Individuazione di popolazioni geneticamente divergenti e potenziale correlazione con gli stock di pesca Analisi di processi demografici storici e recenti Tracciabilità del pescato: sicurezza e frodi ACQUACOLTURA Origine dei riproduttori Attribuzione paternità Inquinamento genetico: introduzione volontaria o accidentale in ambienti naturali e semiconfinati rotture delle gabbie e fughe rilascio gameti in gabbia Orata (Sparus aurata)
10 Genetica e Risorse Ittiche CASI DI STUDIO: ACQUACOLTURA AVANNOTTERIE E ALLEVAMENTI riproduttori autoctoni o alloctoni flusso di avannotti dalle avannotterie agli allevamenti grande rimescolamento di giovanili di diversa origine geografica Origine dei riproduttori Analisi di riproduttori di 2 impianti Orata (Sparus aurata) Numerosi campioni di orate naturali raccolti lungo le coste italiane e atlantiche baseline di riferimento Marcatori molecolari: microsatelliti, AFLP Riproduttori di diverse origini geografiche Alta percentuale di individui atlantici
11 Genetica e Risorse Ittiche CASI DI STUDIO: ACQUACOLTURA Inquinamento genetico Efficacia del tagging molecolare Riconoscimento in natura di individui allevati provenienti da fughe e rotture di gabbie. 2 lotti di riproduttori: 1 atlantico, 1 mediterraneo Simulazione di progenie di 25 esemplari per ogni coppia Mescolamento con 40 esemplari naturali Lesina Orata (Sparus aurata) Effetti delle semine Repliche temporali in tre lagune Marcatori molecolari: microsatelliti Sabaudia Orbetello Riconoscimento al 100% allevati/naturali atlantici/mediterranei Entrata naturale avannotti, no semina OMOGENEITA GENETICA TEMPORALE Semine regolari ETEROGENEITA GENETICA TEMPORALE
12 Genetica e Risorse Ittiche PROGETTI EUROPEI AQUAGENOME (genomics.aquaculture-europe.org) AQUAFIRST ( AQUABREEDING ( AQUATRACE ( BASSMAP ( BRIDGEMAP ( FISHBOOST ( FISHTRACE ( FISHPOPTRACE (fishpoptrace.jrc.ec.europa.eu) sequenziamento del genoma e comparazione con BAC maps di specie modello analisi del trascrittoma ed individuazione di geni chiave GENIMPACT ( IMAQUANIM ( LABELFISH ( M.G.E. ( REPROSEL ( TURPRO ( WEALTH (
13 Genetica e Risorse Ittiche CONCLUSIONI Lo strumento genetico e la gestione responsabile delle risorse ittiche Necessità normative (es. semine e rotture delle gabbie) Come ridurre rilascio dei gameti in mare? Genomica miglioramento della qualità del prodotto
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ITTICO - Bollettino N. 483/ Prezzi all'ingrosso praticati il giorno Martedì 02/01/2018
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