Pellet cellulare. Vortexare per sec. Riscaldare il campione in un termoblocco per 10 min a 100 C

Dimensione: px
Iniziare la visualizzazioe della pagina:

Download "Pellet cellulare. Vortexare per 10-30 sec. Riscaldare il campione in un termoblocco per 10 min a 100 C"

Transcript

1 PrepMan Ultra Sample Preparation Reagent Guida Rapida Per informazioni sulla sicurezza far riferimento alla sezione Safety del PrepMan Ultra Sample Preparation Reagent Protocol (PN ). Per tutti i reagenti in grassetto, leggere le MSDS e seguire le relative istruzioni di sicurezza. Indossare occhiali, camici e guanti protettivi. Per una lista dell equipaggiamento richiesto e raccomandato, materiali di consumo e reagenti, far riferimento a PrepMan Ultra Sample Preparation Reagent Protocol. Da una coltura in piastra Da una brodocoltura Selezionare una piccola ansata di cellule o il bordo di una colonia di fungo filamentoso da una piastra di coltura Sospendere le cellule in 100 µl di PrepMan Ultra Sample Preparation Reagent in una provetta da 2,0-ml, per microcentrifuga Pellet cellulare Vortexare per sec Riscaldare il campione in un termoblocco per 10 min a 100 C Centrifugare il campione per 3 min in una microcentrifuga alla velocità massima Trasferire il supernatante in una nuova provetta da microcentrifuga Il supernatante è pronto per la PCR Pipettare 1 ml di brodo di coltura contenente i batteri o i funghi in una provetta da 2,0-ml per microcentrifuga Centrifugare il campione per 3 min in una microcentrifuga alla velocità massima Aspirare e decantare il supernatante Aggiungere 100 µl di PrepMan Ultra Sample Preparation Reagent e lisare Il pellet pipettando su e giù. Chiudere bene il tappo Possibile stopping point, (conservare at 4 C)

2 Per informazioni sulla sicurezza fare riferimento alla sezione Safety nella prefazione a Microseq S rdna Bacterial Identification Kits Protocol (PN ). Per tutte lo sostanze chimiche in grassetto, leggere le norme di sicurezza e seguire le istruzioni di uso. Indossare idonei occhiali, camici e guanti. Summary I due kit componenti Microseq S rdna Bacterial Identification Kit includono tutti i reagenti necessari per il sequenziamento delle prime 500 paia di basi del gene batterico per il RNA ribosomiale 16S (16S rdna). La sequenza di DNA che ne risulta viene analizzata e confrontata con un database di sequenze geniche batteriche di 16S rdna, utilizzando il software Microseq ID Analysis. Questa Quick Reference Card contiene procedure semplificate per l uso dei kit Microseq 500. Il Protocollo del kit Microseq S rdna Bacterial Identification (PN ) contiene procedure dettagliate. Contenuto dei kit Il sistema Microseq 500 comprende il kit di PCR (PN ) ed il kit di Sequenziamento (PN ). La tabella seguente descrive i componenti di ciascun kit. Kit Componenti Descrizione Microseq S rdna Bacterial Identification PCR Kit (PN ) Master mix per PCR Una provetta contenente PCR Master Mix 2X che è destinata all amplificazione di sequenze geniche del gene del rrna 16S a partire da DNA genomico batterico. Questa provetta contiene una quantità di Master Mix sufficiente per 50 amplificazioni in PCR, 5 controlli negativi e 5 controlli positivi DNA, controllo positivo Una provetta di DNA, controllo positivo (E. coli), a 1 ng/µl, sufficiente per effettuare 10 controlli positivi Controllo negativo (acqua) Una provetta di controllo negativo Microseq S rdna Bacterial Identification Sequencing Kit (PN Master mix per il sequenziamento forward ) Master mix per il sequenziamento reverse Due provette contenenti ciascuna mix sufficiente per 50 reazioni (50 di sequenziamento e 5 di controllo) Due provette contenenti ciascuna mix sufficiente per 50 reazioni (50 di sequenziamento e 5 di controllo)

3 indica i possibili punti di interruzione Estrarre il DNA genomico del batterio usando PrepMan TM Ultra Sample Preparation Reagent (PN ) Conservare il supernatante a 20 C Far riferimento al PrepMan TM Ultra Sample Preparation Reagent Protocol (PN ) o al di Microseq S rdna Bacterial Identification Kits Protocol (PN ) per informazioni più dettagliate a. Pipettare 495 µl di acqua nuclease-free (Ambion PN 9937) in una provettina da microcentrifuga da 1,5-mL b. Utilizzare 5 µl del supernatante del campione estratto con PrepMan Ultra, per ottenere una diluizione 1:100 c. Vortexare per miscelare la soluzione d. Conservare il supernatante batterico rimanente a 20 C La PCR è ottimizzata per l uso con circa 25 ng di DNA genomico Per preparare... Mescolare... Controlli negativi 15 µl del modulo PCR 15 µl di acqua nuclease-free Controlli positivi 15 µl del modulo PCR 15 µl di DNA di controllo. E. coli positivo Campioni 15 µl del modulo PCR 15 µl di soluzione di lavoro Tappare le provettine o sigillare la micropiastra a 96 pozzetti e inserirli nel termociclatore. a. Programmare il termociclatore 9600 in modalità emulazione 9600, come segue: Step Per 30 cicli** Estensione Step iniziale* Melt Anneal Estensione finale finale HOLD CICLI HOLD HOLD 90 C 10 min 95 C 30 sec 60 C 30 sec 72 C 45 sec 72 C 10 min 4 C * è necessario un riscaldamento iniziale per 10 min a 95 C per l attivazione della AmpliTaq Gold DNA Polymerase ** è possibile aumentare il numero dei cicli per aumentare la resa della PCR, questo può però causare un aumento del background del controllo negativo b. Tarare il volume di reazione a 30 µl e far partire l amplificazione c. Conservare il prodotto di PCR a 15/25 C fino al momento dell uso

4 Verificare la presenza del prodotto di PCR facendolo correre su gel di agarosio al 2%. 10 µl di prodotto di PCR per corsia sono sufficienti per rilevare la presenza di DNA amplificato dopo colorazione con bromuro di etidio Nota: L uso di E-gel al 2% (Invitrogen G ) permette una verifica rapida della presenza del prodotto di PCR. Leggere le norme di sicurezza fornite dal produttore prima di stoccare, manipolare o lavorare con materiali pericolosi Il controllo positivo ed i campioni dovrebbero presentare un prodotto di PCR compreso fra pb, a seconda della specie batterica. Il controllo negativo non deve presentare alcun prodotto di PCR Dopo la corsa su gel rimangono 20 µl di prodotto di PCR. Rimuovere dal prodotto di PCR i dntp non usati ed i primer usando uno dei prodotti seguenti: ExoSap-IT (USB PN 78200; Leggere le norme di sicurezza fornite dal produttore prima di stoccare, manipolare o lavorare con materiali pericolosi Montage PCR Filter Unit (Millipore PNUFC7 PCR50) Seguire accuratamente le indicazioni del produttore relative al volume di partenza per la purificazione a. In una provetta da microcentrifuga da 0,2 ml, o in un pozzetto di una piastra microtiter miscelare: 7 µl di prodotto di PCR purificato 13 µl di Sequencing Module b. Tappare le provette o sigillare la piastra e introdurli nel termociclatore a. Programmare il termociclatore 9600 in modalità emulazione 9600, usando le condizioni seguenti: Per 25 cicli Melt Anneal Estensione CICLI 96 C 50 C 60 C 10 sec 5 sec 4 min Step finale HOLD 4 C b. Tarare il volume di reazione a 20 µl e far partire l amplificazione c. Conservare i prodotti di amplificazione a 4 C overnight o a 20 C per non più di una settimana

5 Dopo i cicli di sequenziamento togliere i dye terminator ed i primer in eccesso utilizzando uno dei seguenti prodotti: Se la PCR è stata eseguita in... Usare... Provette da microcentrifuga DyeEx TM 2.0 Spin Kit (Qiagen PN 63204) Piastra a 96 pozzetti DyeEx 96 Kit (Qiagen PN 63181) Seguire le istruzioni allegate al kit a. accertarsi che lo strumento sia configurato secondo i parametri contenuti nella tabella seguente: Strumento Filtro Run Module Basecaller* DyeSet/Primer (Mobility File) 310 E Seq POP6 (1mL)E KB.bcp DTPOP6{BD}. mob Avant E StdSeq50_ POP6 KB.bcp KB_3100_POP6 (BD)v2.mob xl E LongSeq50_ POP7_1 KB.bcp KB_3730_POP7_ BDTv1.mob * Applied Biosystems raccomanda di usare, per basecaller e mobility file, i nomi elencati nella tabella con il software Data Collection 2.0(DC 2.0). Alcuni basecaller e mobility file destinati a precedenti versioni del software sono compatibili con il software DC 2.0. Essi sono elencati nell Appendice A del Microseq S rdna Bacterial Identification Kit Protocol (PN ) IMPORTANTE! E necessari usare l array dei capillari da 50 cm indipendentemente dallo strumento usato b. Spin down le provette da microcentrifuga contenenti i prodotti di PCR purificati c. Risospendere il DNA in 15 µl HI-DI TM Formamide (PN ) d. Eseguire la corsa di sequenziamento e. Trasferire i file al software Microseq Analysis Nota: La risospensione in formamide è procedura di caricamento raccomandata. In alternativa è possibile caricare direttamente sullo strumento da 10 a 20 µl dei prodotti di PCR. Questa procedura può tuttavia necessitare di essere ottimizzata. Per esempio, può essere necessario modificare il tempo di iniezione se il segnale è troppo alto

6 Per informazioni sulla sicurezza fare riferimento alla sezione Safety nella prefazione di Microseq Full Gene 16S rdna Bacterial Identification Kits Protocol (PN ). Per tutte lo sostanze chimiche in grassetto, leggere le norme di sicurezza e seguire le istruzioni di uso. Indossare idonei occhiali, camici e guanti. Summary Microseq Full Gene 16S rdna Bacterial Identification PCR Kit (PN ) e Microseq Full Gene 16S rdna Bacterial Identification Sequencing Kit (PN ) includono tutti i reagenti necessari per il sequenziamento del gene per il RNA ribosomiale 16S (16S rdna). La sequenza di DNA che ne risulta viene analizzata e confrontata con un database di sequenze geniche batteriche di 16S rdna, utilizzando il software Microseq ID Analysis. La Quick Reference Card contiene procedure semplificate per l uso dei kit Microseq Full Gene 16S rdna Bacterial Identification. Il Protocollo del kit Microseq Full Gene 16S rdna Bacterial Identification contiene procedure dettagliate. Contenuto dei kit Il sistema Microseq Full Gene 16S rdna Bacterial Identification comprende due kit: PCR e Sequenziamento. La tabella seguente descrive i componenti di ciascun kit. Kit Componenti Descrizione Microseq Full Gene 16S rdna Bacterial Identification PCR Kit (PN ) Master mix per PCR Tre differenti provette contenenti PCR Master Mix 2X. Ciascuna provetta è destinata all amplificazione di una specifica porzione del gene del rrna 16S a partire da DNA genomico batterico. Ciascuna provetta contiene una quantità di Master Mix sufficiente per 10 amplificazioni, 5 controlli negativi e 5 controlli positivi DNA, controllo positivo Una provetta di DNA, controllo positivo, a 1 ng/µl Controllo negativo (acqua) Una provetta di controllo negativo Microseq Full Gene 16S rdna Bacterial Identification Sequencing Kit (PN ) Master mix per il sequenziamento forward Master mix per il sequenziamento reverse Tre provette distinte contenenti mix sufficiente per 15 reazioni (10 di sequenziamento e 5 di controllo) Ciascuna provetta corrisponde ad una provetta di PCR Master Mix del kit PCR Tre provette distinte contenenti mix sufficiente per 15 reazioni (10 di sequenziamento e 5 di controllo) Ciascuna provetta corrisponde ad una provetta di PCR Master Mix del kit PCR

7 Indica i possibili punti di interruzione Estrarre il DNA genomico del batterio usando PrepMan TM Ultra Sample Preparation Reagent (PN ) Conservare il supernatante a 20 C Far riferimento al PrepMan TM Ultra Sample Preparation Reagent Protocol (PN ) o al di Microseq Full Gene 16S rdna Bacterial Identification Kits Protocol (PN ) per informazioni più dettagliate a. Pipettare 495 µl di acqua nuclease-free (Ambion PN 9937) in una provettina da microcentrifuga da 1,5-mL b. Aggiungere 5 µl di supernatante di PrepMan Ultra, ottenendo una diluizione 1:100 c. Vortexare per miscelare la soluzione d. Conservare il supernatante batterico rimanente a 20 C Il kit PCR è ottimizzato per l uso con circa 25 ng di DNA genomico batterico Nota: Se necessario fare altre diluizioni della soluzione di lavoro prima di eseguire la PCR per minimizzare l effetto degli inibitori della PCR Per preparare... Mescolare... Controlli negativi 15 µl Master Mix PCR 2x 15 µl di acqua nuclease-free Controlli positivi 15 µl Master Mix PCR 2x 15 µl di DNA di controllo. E. coli positivo Campioni 15 µl Master Mix PCR 2x 15 µl di soluzione di lavoro (diluizione:100) Nota: dovrebbero aversi tre provette per ciascun campione, uno per ciascuna delle tre PCR Master Mix del kit Microseq Full Gene PCR Tappare le provettine o sigillare la micropiastra a 96 pozzetti e inserirli nel termociclatore.

8 a. Programmare il termociclatore 9600 in modalità emulazione 9600, come segue: Step Per 30 cicli** Estensione Step iniziale* Melt Anneal Estensione finale finale HOLD CICLI HOLD HOLD 95 C 10 min 95 C 30 sec 60 C 30 sec 72 C 45 sec 72 C 10 min 4 C * è necessario un riscaldamento iniziale per 10 min a 95 C per l attivazione della AmpliTaq Gold DNA Polymerase ** è possibile aumentare il numero dei cicli per aumentare la resa della PCR, questo può però causare un aumento del background del controllo negativo b. Tarare il volume di reazione a 30 µl e far partire l amplificazione c. Conservare il prodotto di PCR a 15/25 C fino al momento dell uso Verificare la presenza del prodotto di PCR facendo correre 10 µl di campione su gel di agarosio al 2%. 10 µl di prodotto di PCR sono sufficienti per rilevare la presenza di DNA amplificato dopo colorazione con bromuro di etidio In alternativa usare E-gel al 2% (Invitrogen G ). Leggere le norme di sicurezza fornite dal produttore Il controllo positivo ed i campioni dovrebbero presentare 3 prodotti di PCR: 1 banda di pb e 2 bande di pb. Le dimensioni del prodotto possono variare a seconda della specie batterica. Il controllo negativo non deve presentare alcun prodotto di PCR Nota: se non si evidenziano prodotti di PCR la causa più probabile sono gli inibitori della PCR. Per ulteriori informazioni consultare la sezione Troubleshooting del protocollo Microseq Full Gene 16S rdna Bacterial Identification Kits

9 Dopo la corsa su gel rimangono 20 µl di prodotto di PCR. Rimuovere dal prodotto di PCR i dntp non usati ed i primer usando uno dei metodi seguenti consigliati da Applied Biosystems: ExoSap-IT (USB PN 78200; Seguire le istruzioni del produttore Montage PCR Filter Unit (Millipore PNUFC7 PCR50) Seguire accuratamente le indicazioni del produttore relative al volume di partenza per la purificazione a. In 2 provette da microcentrifuga da 0,2 ml, o in 2 pozzetti di una piastra microtiter miscelare: 7µL di prodotto di PCR purificato e 13µL della master mix forward di sequenziamento 7µL di prodotto di PCR purificato e 13µL della master mix reverse di sequenziamento b. Tappare le provette o sigillare la piastra e introdurli nel termociclatore IMPORTANTE! Aver cura di usare le master mix di sequenziamento forward e reverse corrispondenti alle master mix di PCR usate in precedenza Nota: dopo lo step di amplificazione si avevano 3 provette per campione (una per ciascuna delle 3 master mix di PCR). Adesso, preparando una reazione di sequenziamento forward ed una reverse, il numero totale delle provette sale a sei

10 a. Programmare il termociclatore 9600 in modalità emulazione 9600, usando le condizioni seguenti: Per 25 cicli Melt Anneal Estensione CICLI 96 C 50 C 60 C 10 sec 5 sec 4 min Step finale HOLD 4 C b. Tarare il volume di reazione a 20 µl e far partire l amplificazione c. Conservare i prodotti di amplificazione a 4 C overnight o a 20 C per non più di una settimana Dopo i cicli di sequenziamento togliere i dye terminator ed i primer in eccesso utilizzando uno dei seguenti prodotti: Se la PCR è stata eseguita in... Applied Biosystems raccomanda l uso di... Provette da microcentrifuga DyeEx TM 2.0 Spin Kit (Qiagen PN 63204) Piastra a 96 pozzetti DyeEx 96 Kit (Qiagen PN 63181) Seguire le istruzioni allegate al kit a. accertarsi che lo strumento sia configurato secondo i parametri contenuti nella tabella seguente: Strumento Filtro Run Module Basecaller* DyeSet/Primer (Mobility File) 310 E Seq POP6 (1mL)E KB.bcp KB_310_POP6_ BDTv1_ 50Std.mob 3100 E StdSeq50_ KB.bcp KB_3100_POP6_ 3100-Avant xl E POP6_1 LongSeq50_ POP7 KB.bcp BDTv1.mob KB_3730_POP7_ BDTv1.mob * Applied Biosystems raccomanda di usare, per basecaller e mobility file, i nomi elencati nella tabella con il software Data Collection 2.0(DC 2.0). Alcuni basecaller e mobility file destinati a precedenti versioni del software sono compatibili con il software DC 2.0. Far riferimento a Microseq ID Analysis Software Online help per maggiori informazioni riguardo alle convenzioni relativi ai nomi di basecaller e mobility file IMPORTANTE! E necessari usare l array dei capillari da 50 cm indipendentemente dallo strumento usato (prosegue nella pagina successiva)

11 b. Spin down le provette da microcentrifuga contenenti i prodotti di PCR purificati c. Risospendere il DNA in 15 µl di HI-DI TM Formamide (PN ) d. Eseguire la corsa di sequenziamento e. Trasferire i file al software Microseq ID Analysis IMPORTANTE! La risospensione in formamide è procedura di caricamento raccomandata. In alternativa è possibile caricare direttamente sullo strumento da 10 a 20 µl dei prodotti di PCR. Questa procedura può tuttavia necessitare di essere ottimizzata. Per esempio, può essere necessario modificare il tempo di iniezione se il segnale è troppo alto

Istruzioni per l uso GenDx SBTexcellerator

Istruzioni per l uso GenDx SBTexcellerator Ottavo edizione Luglio 2011 Istruzioni per l uso GenDx SBTexcellerator Sequence-based typing (SBT) per HLA ad alta risoluzione Genome Diagnostics B.V. Telefono: +31 302 523 799 e-mail: info@gendx.com Web:

Dettagli

SERVIZIO DI SEQUENZIAMENTO AUTOMATICO

SERVIZIO DI SEQUENZIAMENTO AUTOMATICO REPARTO GENOMICA LABORATORIO ANALISI GENOMICHE SERVIZIO DI SEQUENZIAMENTO AUTOMATICO DOCUMENTO ILLUSTRATIVO DEL SERVIZIO DI SEQUENZIAMENTO ACIDI NUCLEICI ISTITUTO ZOOPROFILATTICO SPERIMENTALE DELLA LOMBARDIA

Dettagli

DALL ESTRAZIONE DEL DNA AL FINGERPRINTING

DALL ESTRAZIONE DEL DNA AL FINGERPRINTING DALL ESTRAZIONE DEL DNA AL FINGERPRINTING SCOPO DELL'ATTIVITÀ Ciascuno studente estrae il proprio DNA da cellule della mucosa boccale. Quindi, mediante PCR, vengono amplificati frammenti corrispondenti

Dettagli

Istruzioni d uso. BAG Cycler Check. REF 7104 (10 test) REF 71044 (4 test) Kit per la validazione dell uniformità della temperatura nei termociclatori

Istruzioni d uso. BAG Cycler Check. REF 7104 (10 test) REF 71044 (4 test) Kit per la validazione dell uniformità della temperatura nei termociclatori Istruzioni d uso BAG Cycler Check REF 7104 (10 test) REF 71044 (4 test) Kit per la validazione dell uniformità della temperatura nei termociclatori pronto all uso, prealiquotato Indice 1. Descrizione del

Dettagli

PCR. (Reazione a catena della polimerasi) ESTRAZIONE del DNA da gel di AGAROSIO. Corso di INGEGNERIA GENETICA, Prof. Renato Fani,

PCR. (Reazione a catena della polimerasi) ESTRAZIONE del DNA da gel di AGAROSIO. Corso di INGEGNERIA GENETICA, Prof. Renato Fani, PCR (Reazione a catena della polimerasi) & ESTRAZIONE del DNA da gel di AGAROSIO Corso di INGEGNERIA GENETICA, Prof. Renato Fani, ESERCITAZIONE DI LAB. N.2 La PCR (Polymerase Chain Reaction) è una tecnica

Dettagli

Protocollo Crime Scene Investigation

Protocollo Crime Scene Investigation Protocollo Crime Scene Investigation Precauzioni da adottare in laboratorio: - non mangiare o bere - indossare sempre i guanti quando si maneggiano i tubini, i gel, le micropipette - nel dubbio, chiedere!

Dettagli

Soluzioni e tamponi utilizzati per la PCR, senza DNA

Soluzioni e tamponi utilizzati per la PCR, senza DNA Materiali biologici In questo file sono elencati, capitolo per capitolo, i materiali biologici da richiedere al CusMiBio (o centro simile) per realizzare gli esperimenti che abbiamo illustrato (www.cusmibio.unimi.it).

Dettagli

Orga Bio Human S.r.l. DIREZIONE E UFFICI: Via Amsterdam 75, 00144 Roma Tel/fax: 06 99701675

Orga Bio Human S.r.l. DIREZIONE E UFFICI: Via Amsterdam 75, 00144 Roma Tel/fax: 06 99701675 Orga Bio Human S.r.l. DIREZIONE E UFFICI: Via Amsterdam 75, 00144 Roma Tel/fax: 06 99701675 SEDE LEGALE: Via Helsinki 21, 00144 Roma Tel. 06 97998273; Fax 06 52246148 e-mail: orgabiohuman@fastwebnet.it

Dettagli

Protocollo di laboratorio per la purificazione manuale del DNA a partire da 0,5 ml di campione

Protocollo di laboratorio per la purificazione manuale del DNA a partire da 0,5 ml di campione Protocollo di laboratorio per la purificazione manuale del DNA a partire da 0,5 ml di campione Per la purificazione del DNA genomico proveniente dai kit di prelievo Oragene e ORAcollect. Per le istruzioni

Dettagli

Verifiche qualitative dell RNA e cdna in ambito dei trials BCR/ABL e AML translocation programme. Massimo Degan, CRO Aviano (PN)

Verifiche qualitative dell RNA e cdna in ambito dei trials BCR/ABL e AML translocation programme. Massimo Degan, CRO Aviano (PN) e cdna in ambito dei trials BCR/ABL e AML translocation programme Massimo Degan, CRO Aviano (PN) perchè è importante verificare l RNA La verifica della qualità dell RNA nei saggi diagnostico-molecolari

Dettagli

Esercitazione di Laboratorio corso Prof Tuberosa Biotecnologie genetiche agrarie Laurea in Biotecnologie (terzo anno).

Esercitazione di Laboratorio corso Prof Tuberosa Biotecnologie genetiche agrarie Laurea in Biotecnologie (terzo anno). Esercitazione di Laboratorio corso Prof Tuberosa Biotecnologie genetiche agrarie Laurea in Biotecnologie (terzo anno). Programma: Giorno 1Preparazione di DNA genomico da foglie 2 - Controllo qualità DNA

Dettagli

Istruzioni d'uso. Amplificazione e sequenziamento mediante PCR dei loci HLA di classe I e II. Versione n.: 13.0 Data di pubblicazione: luglio 2013

Istruzioni d'uso. Amplificazione e sequenziamento mediante PCR dei loci HLA di classe I e II. Versione n.: 13.0 Data di pubblicazione: luglio 2013 Istruzioni d'uso Amplificazione e sequenziamento mediante PCR dei loci HLA di classe I e II Versione n.: 13.0 Data di pubblicazione: luglio 2013 EC REP Conexio Genomics Pty Ltd Qarad bvba 8/31 Pakenham

Dettagli

Identificazione dei microrganismi mediante tecniche di biologia molecolare Esercitazione n 3. Criteri di identificazione

Identificazione dei microrganismi mediante tecniche di biologia molecolare Esercitazione n 3. Criteri di identificazione Identificazione dei microrganismi mediante tecniche di biologia molecolare Esercitazione n 3 Criteri di identificazione Tradizionale (fenotipo) Tecniche di biologia molecolare Il livello di risoluzione

Dettagli

C V C. Istruzioni per l'uso del Biofortuna SSPGo TM HLA Wipe Test BF-40-01. Revisione 3. Luglio 2014

C V C. Istruzioni per l'uso del Biofortuna SSPGo TM HLA Wipe Test BF-40-01. Revisione 3. Luglio 2014 Dot152v1 Instructions for Use for Biofortuna SSPGo TM HLA Wipe Test BF-40-01 Pagina 1 di 8 Istruzioni per l'uso del Biofortuna SSPGo TM HLA Wipe Test BF-40-01 Revisione 3 Luglio 2014 Dot152v1 Instructions

Dettagli

PROGETTO BIOFORM Corso didattico sperimentale. Esercizio. Tipizzazione del gene PV92

PROGETTO BIOFORM Corso didattico sperimentale. Esercizio. Tipizzazione del gene PV92 PROGETTO BIOFORM Corso didattico sperimentale Esercizio Tipizzazione del gene PV92 Elementi trasponibili Che cosa sono gli elementi trasponibili? Sono segmenti di DNA che sono in grado di trasferirsi in

Dettagli

ESTRAZIONE del DNA da gel di AGAROSIO

ESTRAZIONE del DNA da gel di AGAROSIO (Reazione a catena della polimerasi) & ESTRAZIONE del DNA da gel di AGAROSIO Corso di Ingegneria Genetica e Microbiologa Applicata Prof. Renato Fani Percorso1: Analisi della variabilità genetica di popolazioni

Dettagli

Esperienza 10: la PCR

Esperienza 10: la PCR Esperienza 10: la PCR La tecnica della polimerizzazione a catena (in inglese polymerase chain reaction) o PCR, permette di amplificare milioni di volte un unico frammento di DNA. Questo metodo è diventato

Dettagli

REAZIONE A CATENA DELLA POLIMERASI. ( PCR =Polymerase Chain Reaction)

REAZIONE A CATENA DELLA POLIMERASI. ( PCR =Polymerase Chain Reaction) REAZIONE A CATENA DELLA POLIMERASI ( PCR =Polymerase Chain Reaction) Verso la metà degli anni 80, il biochimico Kary Mullis mise a punto un metodo estremamente rapido e semplice per produrre una quantità

Dettagli

Progetto della classe II C

Progetto della classe II C Progetto della classe II C Preparazione allo svolgimento dell esperienza La II C è preparata all esperienza presso il centro di ricerca E.B.R.I. iniziando un intenso lavoro di approfondimento sulla genetica

Dettagli

Preparazione dei campioni da inviare per il sequenziamento

Preparazione dei campioni da inviare per il sequenziamento Preparazione dei campioni da inviare per il sequenziamento PCR preparativa Buffer 10x dntp 2mM Taq polimerasi Oligonucleotidi up e down 100 ng/ul Volume finale 2 ul/campione 2 ul/campione 0,5 U/campione

Dettagli

Manuale del test digene HPV Genotyping LQ, kit di amplificazione

Manuale del test digene HPV Genotyping LQ, kit di amplificazione Aprile 2010 Manuale del test digene HPV Genotyping LQ, kit di amplificazione 96 Versione 1 Per l amplificazione dei genotipi di papilloma virus umano (HPV) ad alto rischio 613215 1057457IT QIAGEN GmbH,

Dettagli

Materiali e Metodi MATERIALI E METODI

Materiali e Metodi MATERIALI E METODI MATERIALI E METODI 62 1. Pazienti con IBS Per eseguire l analisi del polimorfismo 5HTTLPR è stato necessario ottenere campioni di sangue intero o saliva dai quali estrarre il DNA genomico. A tal fine è

Dettagli

1 Finalità d uso. 5 Stabilità e modalità di conservazione. 2 Principio del test. 6 Materiali e strumenti addizionali richiesti e non forniti

1 Finalità d uso. 5 Stabilità e modalità di conservazione. 2 Principio del test. 6 Materiali e strumenti addizionali richiesti e non forniti MYCHLE v.3 1 Finalità d uso RealCycler MYCHLE è un kit di reagenti che permette la rilevazione qualitativa per Real-time PCR del DNA di Mycoplasma pneumoniae, Chlamydophila pneumoniae spp. in campioni

Dettagli

AQUADIEN Kit Codice #: 357-8121 96 test

AQUADIEN Kit Codice #: 357-8121 96 test AQUADIEN Kit Codice #: 357-8121 96 test Manuale d istruzioni KIT PER L ESTRAZIONE E LA PURIFICAZIONE DI DNA A PARTIRE DA BATTERI CONTENUTI NEI CAMPIONI DI ACQUA SOMMARIO I. INTRODUZIONE II. III. IV. COMPOSIZIONE

Dettagli

C V C. Istruzioni per l'uso del Biofortuna SSPGo TM HLA No Template Control Kit BF-40-02. Revisione 2. Luglio 2014

C V C. Istruzioni per l'uso del Biofortuna SSPGo TM HLA No Template Control Kit BF-40-02. Revisione 2. Luglio 2014 DOT136v1 Instructions for Use Biofortuna SSPGo TM HLA No Template Control Kit BF-40-02 Pagina 1 di 7 Istruzioni per l'uso del Biofortuna SSPGo TM HLA No Template Control Kit BF-40-02 Revisione 2 Luglio

Dettagli

ALLEGATO A CAPITOLATO TECNICO. Art. n. 1 Oggetto e quantità della fornitura

ALLEGATO A CAPITOLATO TECNICO. Art. n. 1 Oggetto e quantità della fornitura ALLEGATO A GARA PER LA FORNITURA IN SERVICE DI SISTEMI PER LA PURIFICAZIONE DI ACIDI NUCLEICI E PER L ALLESTIMENTO DI REAZIONI DI PRE-PCR E POST-PCR SU PIATTAFORMA ROBOTIZZATA Azienda Ospedaliera di Padova

Dettagli

PRINCIPALI TIPI DI PCR a) PRINCIPALI TIPI DI PCR b)

PRINCIPALI TIPI DI PCR a) PRINCIPALI TIPI DI PCR b) PRINCIPALI TIPI DI PCR a) RT-PCR: serve a valutare l espressione di un gene tramite l amplificazione dell mrna da esso trascritto PCR COMPETITIVA: serve a valutare la concentrazione iniziale di DNA o RNA

Dettagli

PROGETTO DNA chiavi in mano. Le Biotecnologie in classe e in laboratorio 11/03/2015 Prof.ssa Paola Cazzani I.T.E. A. Bassi - Lodi

PROGETTO DNA chiavi in mano. Le Biotecnologie in classe e in laboratorio 11/03/2015 Prof.ssa Paola Cazzani I.T.E. A. Bassi - Lodi PROGETTO DNA chiavi in mano Le Biotecnologie in classe e in laboratorio 11/03/2015 Prof.ssa Paola Cazzani I.T.E. A. Bassi - Lodi PROGETTO DNA chiavi in mano PROGETTO DNA chiavi in mano IFOM PROGETTO DNA

Dettagli

III giorno: Da questo punto in poi, per entrambe le tipologie di campioni, si segue un protocollo comune:

III giorno: Da questo punto in poi, per entrambe le tipologie di campioni, si segue un protocollo comune: III giorno: 1) Estrazione del DNA genomico da campioni SECCHI e da coltura liquida 2) Preparazione del gel di agarosio 3) Corsa del DNA genomico in gel di agarosio e sua visualizzazione 4) PCR del DNA

Dettagli

Indice. Informazioni sulla sicurezza 2. Pulizia e smaltimento 4. Specifiche 4. Informazioni per gli ordinativi del sistema FlashGel 33

Indice. Informazioni sulla sicurezza 2. Pulizia e smaltimento 4. Specifiche 4. Informazioni per gli ordinativi del sistema FlashGel 33 Sistema FlashGel Lonza Rockland, Inc. www.lonza.com scientific.support@lonza.com Supporto scientifico: 00 32 87 321 611 Servizio clienti: 0039 0363 45710 Rockland, ME 04841 Indice Informazioni sulla sicurezza

Dettagli

BIOTECNOLOGIE pag 1 di 12 POS VIR 001 INT rev. 0 del 05/02/2008 ORGANISMI GENETICAMENTE MODIFICATI (OGM): MONITOR PCR HMG

BIOTECNOLOGIE pag 1 di 12 POS VIR 001 INT rev. 0 del 05/02/2008 ORGANISMI GENETICAMENTE MODIFICATI (OGM): MONITOR PCR HMG BIOTECNOLOGIE pag 1 di 12 Redatto: F.Gatto Verificato Responsabile Struttura Semplice: I.M.Ciabatti Verificato RQ: M.Guarducci Approvato Responsabile di Struttura Complessa: D.Amaddeo BIOTECNOLOGIE pag

Dettagli

PROGETTO DNA CHIAVI IN MANO

PROGETTO DNA CHIAVI IN MANO PROGETTO DNA CHIAVI IN MANO La collaborazione con il Virgilio e il progetto dell IFOM Il progetto DNA chiavi in mano è un percorso pensato dal Centro di Ricerca internazionale IFOM per avvicinare i ragazzi

Dettagli

Maxwell 16 Blood DNA Purification System

Maxwell 16 Blood DNA Purification System Manuale Tecnico Maxwell 16 Blood DNA Purification System Attenzione maneggiare le cartucce con attenzione, le estremità dei sigilli possono essere taglienti. 2800 Woods Hollow Rd. Madison, WI USA Dispositivo

Dettagli

Kit per la determinazione di contaminazioni in biologia molecolare REF 7091. 40 Reazioni

Kit per la determinazione di contaminazioni in biologia molecolare REF 7091. 40 Reazioni IT Istruzioni d uso Wipe test Controllo di contaminazione Kit per la determinazione di contaminazioni in biologia molecolare REF 7091 40 Reazioni 1. Descrizione del prodotto Per impedire le contaminazioni

Dettagli

Maria Antonietta Lepore. Principali tecniche di biologia molecolare clinica

Maria Antonietta Lepore. Principali tecniche di biologia molecolare clinica Maria Antonietta Lepore Principali tecniche di biologia molecolare clinica Copyright MMIX ARACNE editrice S.r.l. www.aracneeditrice.it info@aracneeditrice.it via Raffaele Garofalo, 133 a/b 00173 Roma (06)

Dettagli

Detergente enzimi (es. preparato per ammorbidire la

Detergente enzimi (es. preparato per ammorbidire la LABORATORIO 2: ESTRAZIONE ED ANALISI ELETTROFORETICA DI DNA GENOMICO Come fare? Seguiamo 3 semplici passaggi: Detergente enzimi (es. preparato per ammorbidire la carne) Alcol Cooome?? E' così facile??

Dettagli

Test per il rilevamento o la quantificazione tramite PCR in real-time di Legionella spp. e Legionella pneumophila nei campioni di acqua

Test per il rilevamento o la quantificazione tramite PCR in real-time di Legionella spp. e Legionella pneumophila nei campioni di acqua iq-check Screen Legionella spp. Kit Codice #: 357-8104 iq-check Quanti Legionella spp. Kit Codice #: 357-8102 iq-check Screen L. pneumophila Kit Codice #: 357-8105 iq-check Quanti L. pneumophila Kit Codice

Dettagli

BIOTECNOLOGIE pag 1 di 11 POS VIR 017 INT rev. 1 del 19/06/2009 ORGANISMI GENETICAMENTE MODIFICATI (OGM): MONITOR PCR LECTINA

BIOTECNOLOGIE pag 1 di 11 POS VIR 017 INT rev. 1 del 19/06/2009 ORGANISMI GENETICAMENTE MODIFICATI (OGM): MONITOR PCR LECTINA BIOTECNOLOGIE pag 1 di 11 Redatto: F.Gatto Verificato Responsabile Struttura Semplice: I.Ciabatti Verificato RQ: M.Guarducci Approvato Responsabile di Struttura Complessa: D.Amaddeo BIOTECNOLOGIE pag 2

Dettagli

BIOTECNOLOGIE pag 1 di 11 POS VIR 003 INT rev. 0 del 05/02/2008 ORGANISMI GENETICAMENTE MODIFICATI (OGM): TERMINATORE NOS

BIOTECNOLOGIE pag 1 di 11 POS VIR 003 INT rev. 0 del 05/02/2008 ORGANISMI GENETICAMENTE MODIFICATI (OGM): TERMINATORE NOS BIOTECNOLOGIE pag 1 di 11 Redatto: U.Marchesi Verificato Responsabile Struttura Semplice: I.M.Ciabatti Verificato RQ: M.Guarducci Approvato Responsabile di Struttura Complessa: D.amaddeo BIOTECNOLOGIE

Dettagli

TECNICHE DI BIOLOGIA MOLECOLARE. LA REAZIONE POLIMERASICA A CATENA Principi teorici e aspetti pratici

TECNICHE DI BIOLOGIA MOLECOLARE. LA REAZIONE POLIMERASICA A CATENA Principi teorici e aspetti pratici TECNICHE DI BIOLOGIA MOLECOLARE LA REAZIONE POLIMERASICA A CATENA Principi teorici e aspetti pratici POLYMERASE CHAIN REACTION (PCR) 1955 A. Kronembreg e coll. (Stanford University) scoprono la DNA-polimerasi

Dettagli

Il primer utilizzato può essere specifico per il gene che si intende amplificare oppure aspecifico (oligo (dt) oppure random esameri).

Il primer utilizzato può essere specifico per il gene che si intende amplificare oppure aspecifico (oligo (dt) oppure random esameri). Retrotrascrizione l mrna viene convertito in cdna per mezzo dell enzima trascrittasi inversa (DNA polimerasi RNAdipendenti ricavate dai virus della mieloblastosi aviaria AMV o della leucemia murina di

Dettagli

GenoType MTBC VER 1.X. Deutsch: S. 2-14 English: p. 15-26 Français : p. 27-39 Italiano: p. 40-52 Español: p. 53-65 Português: p. 66-78 Česky: s.

GenoType MTBC VER 1.X. Deutsch: S. 2-14 English: p. 15-26 Français : p. 27-39 Italiano: p. 40-52 Español: p. 53-65 Português: p. 66-78 Česky: s. GenoType MTBC VER 1.X Deutsch: S. 2-14 English: p. 15-26 Français : p. 27-39 Italiano: p. 40-52 Español: p. 53-65 Português: p. 66-78 Česky: s. 79-91 04/2006 GenoType MTBC Test genetico molecolare per

Dettagli

Analisi mutazionale di K-RAS metodiche a confronto

Analisi mutazionale di K-RAS metodiche a confronto Analisi mutazionale di K-RAS metodiche a confronto Aula Magna Villa Sironi Gallarate 16 ottobre Dott. Carmelo Lupo Coordinatore Tecnico Anatomia Patologica e Patologia Molecolare Oncologica PERCHÉ K-RAS

Dettagli

Metodiche Molecolari

Metodiche Molecolari Metodiche Molecolari La rivelazione degli acidi nucleici virali è un altro saggio che può essere utilizzato sia per verificare la presenza di un virus in un determinato campione biologico, sia per studiare

Dettagli

PROGETTO VERSO IL FUTURO CON L INGEGNERIA GENETICA a.s. 2012/2013

PROGETTO VERSO IL FUTURO CON L INGEGNERIA GENETICA a.s. 2012/2013 PROGETTO VERSO IL FUTURO CON L INGEGNERIA GENETICA a.s. 2012/2013 PROTOCOLLI SPERIMENTALI FASE 1: Preparazione delle cellule competenti modificato da Maniatis Metodo Materiali Motivazioni Strumenti Utilizzare

Dettagli

ThromboType test (HPA 1-6, 15)

ThromboType test (HPA 1-6, 15) ISTRUZIONI PER L USO ThromboType test (HPA 1-6, 15) REF THROMBOTYPE IVD ThromboType Reagenti E-Gel 48 INDICE USO... 2 RIASSUNTO E SPIEGAZIONE... 2 PRINCIPIO... 2 REAGENTI... 2 AVVERTENZE... 3 PRECAUZIONI...

Dettagli

HISTO SPOT On-Call Typing Kit

HISTO SPOT On-Call Typing Kit Istruzioni per l uso HISTO SPOT On-Call Typing Kit REF 726070 Kit per test di tipizzazione tissutale HLA in biologia molecolare 10 test per HLA-A, B, C, DRB1, DRB3/4/5, DQ, DPB1 IVD 0123 Versione: 03/2014

Dettagli

ESTRAZIONE ACIDI NUCLEICI CON PARTICOLARE RIFERIMENTO A DNA ESTRATTO DA TESSUTI FISSATI IN FORMALINA E INCLUSI IN PARAFFINA (FFPE)

ESTRAZIONE ACIDI NUCLEICI CON PARTICOLARE RIFERIMENTO A DNA ESTRATTO DA TESSUTI FISSATI IN FORMALINA E INCLUSI IN PARAFFINA (FFPE) ESTRAZIONE ACIDI NUCLEICI CON PARTICOLARE RIFERIMENTO A DNA ESTRATTO DA TESSUTI FISSATI IN FORMALINA E INCLUSI IN PARAFFINA (FFPE) SALVATORE GIRLANDO LABORATORIO PATOLOGIA MOLECOLARE ANATOMIA PATOLOGICA

Dettagli

SEQUENZIAMENTO DEL DNA

SEQUENZIAMENTO DEL DNA SEQUENZIAMENTO DEL DNA Il metodo di Sanger per determinare la sequenza del DNA Il metodo manuale La reazione enzimatica Elettroforesi in gel denaturante di poliacrilammide Autoradiografia Il metodo automatico

Dettagli

IVD. IVD Diagnostici in Vitro. ThromboFil

IVD. IVD Diagnostici in Vitro. ThromboFil IVD IVD Diagnostici in Vitro ThromboFil Genotipizzazione molecolare del Fattore V di Leiden, Fattore II, MTHFR C677T, MTHFR A1298C attraverso Multiplex PCR / elettroforesi capillare Codice MDS-PTF-001

Dettagli

V Giornata di Genetica Forense Roma, 5 giugno 2013 INDAGINI GENETICHE SU REPERTI OSSEI MEDIANTE POWERPLEX FUSION SYSTEM: RISULTATI PRELIMINARI

V Giornata di Genetica Forense Roma, 5 giugno 2013 INDAGINI GENETICHE SU REPERTI OSSEI MEDIANTE POWERPLEX FUSION SYSTEM: RISULTATI PRELIMINARI V Giornata di Genetica Forense Roma, 5 giugno 2013 INDAGINI GENETICHE SU REPERTI OSSEI MEDIANTE POWERPLEX FUSION SYSTEM: RISULTATI PRELIMINARI Silvia Zoppis, Manuela Rosini, Carla Vecchiotti Università

Dettagli

Dott.ssa Quintarelli Concetta

Dott.ssa Quintarelli Concetta Dott.ssa Quintarelli Concetta Estrazione e quantizzazione degli acidi nucleici Pre-PCR Accetazione Post-PCR Refertazione Area PCR GUANTI MONOUSO PUNTALI CON FILTRO CESTELLO PER GHIACCIO TUBINI PCR Materiale

Dettagli

Quantificazione di. legionella pneumophila. mediante metodo biomolecolare

Quantificazione di. legionella pneumophila. mediante metodo biomolecolare Quantificazione di legionella pneumophila mediante metodo biomolecolare Laboratorio di Epidemiologia Genetica e Genomica di Sanità Pubblica Istituto di Igiene LABORATORIO DI EPIDEMIOLOGIA GENETICA: ATTIVITA

Dettagli

Studio delle popolazioni microbiche riguardanti processi di fermentazione anaerobica in condizioni di mesofilia

Studio delle popolazioni microbiche riguardanti processi di fermentazione anaerobica in condizioni di mesofilia Agenzia Nazionale per le Nuove Tecnologie, l nergia e lo Sviluppo conomico Sostenibile RICRCA DI SISTMA LTTRICO Studio delle popolazioni microbiche riguardanti processi di fermentazione anaerobica in condizioni

Dettagli

Istruzioni d uso HISTO TYPE SSP Kits Bassa risoluzione

Istruzioni d uso HISTO TYPE SSP Kits Bassa risoluzione Istruzioni d uso HISTO TYPE SSP Kits Bassa risoluzione 0123 Kits per la tipizzazione tissutale degli alleli HLA (Classe I: HLA-A, B, C e Classe II: HLA-DR, DQ) in biologia molecolare IVD 20 tipizzazioni

Dettagli

U.O.C. di Epatologia Clinica e Biomolecolare. Unità di misura. Repertorio. 200 ml 10.000 U. 500 test

U.O.C. di Epatologia Clinica e Biomolecolare. Unità di misura. Repertorio. 200 ml 10.000 U. 500 test U.O.C. di Epatologia Clinica e Biomolecolare Lotto N. DESCRIZIONE PRODOTTO Quantità annua richiesta Unità di misura Repertorio CND Codice Prodotto, Confezione Offerta e nome commerciale Prezzo unitario

Dettagli

AMPLIFICAZIONE IN VITRO DEL DNA REAZIONE A CATENA DELLA POLIMERASI (PCR)

AMPLIFICAZIONE IN VITRO DEL DNA REAZIONE A CATENA DELLA POLIMERASI (PCR) AMPLIFICAZIONE IN VITRO DEL DNA REAZIONE A CATENA DELLA POLIMERASI (PCR) PCR: reazione polimerasica a catena Inventata da Kary Mullis negli anni 80 (premio Nobel 1993) Serve per ottenere una grande quantita

Dettagli

1 Finalità d uso. 4 Contenuti. 2 Principio del test. 5 Stabilità e modalità di conservazione

1 Finalità d uso. 4 Contenuti. 2 Principio del test. 5 Stabilità e modalità di conservazione HERPLX v.2 1 Finalità d uso RealCycler HERPLX è un kit di reagenti che permette la rilevazione qualitativa per Real-time PCR del DNA di Herpesvirus tipo 1 (HSV1), Herpesvirus tipo 2 (HSV2), virus Varicella-Zoster

Dettagli

T V A. Il processo analitico è costituito da tre fasi distinte: a) Estrazione - arricchimento b) Retrotrascrizione c) Amplificazione Real Time TM

T V A. Il processo analitico è costituito da tre fasi distinte: a) Estrazione - arricchimento b) Retrotrascrizione c) Amplificazione Real Time TM genedia DIVISIONE BIOMOLECOLARE DETERMINAZIONE QUANTITATIVA DI RNA HCV MEDIANTE HPA (HIGH PERFORMANCE AMPLIFICATION) T V A L HPA è un protocollo d amplificazione che coniuga le conoscenze acquisite con

Dettagli

Genomica Servizio Sequenziamento DNA

Genomica Servizio Sequenziamento DNA Genomica Servizio Sequenziamento DNA Listino prezzi 1 maggio 2005 Value Read Codice Descrizione Prezzo / Lettura 1001-000000 Tubi 13,50 1001-000010 Tubi con etichetta codice a barre 12,00 1094-000050 Etichette

Dettagli

Kit didattico Edvotek: la Tecnica del DNA fingerprinting

Kit didattico Edvotek: la Tecnica del DNA fingerprinting International pbi S.p.A. Milano Copyright pbi MARZO 2003 Kit didattico Edvotek: la Tecnica del DNA fingerprinting Introduzione L analisi del profilo di restrizione del DNA, detto anche DNA fingerprinting,

Dettagli

MycXtra Kit di estrazione per DNA fungino

MycXtra Kit di estrazione per DNA fungino Per uso diagnostico in vitro: MycXtra MycXtra Kit di estrazione per DNA fungino REF 080-005 Uso previsto Il kit di estrazione per DNA fungino MycXtra è studiato per isolare e purificare il DNA fungino

Dettagli

BIOTECNOLOGIE pag 1 di 12 POS VIR 011 INT rev. 2 del 19/06/2009 ORGANISMI GENETICAMENTE MODIFICATI (OGM): MAIS EVENTO DAS1507

BIOTECNOLOGIE pag 1 di 12 POS VIR 011 INT rev. 2 del 19/06/2009 ORGANISMI GENETICAMENTE MODIFICATI (OGM): MAIS EVENTO DAS1507 BIOTECNOLOGIE pag 1 di 12 Redatto: F.Gatto Verificato Responsabile Struttura Semplice: I.Ciabatti Verificato RQ: M.Guarducci Approvato Responsabile di Struttura Complessa: D.Amaddeo BIOTECNOLOGIE pag 2

Dettagli

Scheda tecnica TRI118

Scheda tecnica TRI118 TRI REAGENT - RNA / DNA / PROTEIN ISOLATION REAGENT Cat. No. TR 118/50 Cat. No. TR 118/100 Cat. No. TR 118/200 Produttore: Molecular Research Center Distributore: Bio-Optica Conservare a 4-25 C DESCRIZIONE

Dettagli

Dr.ssa Stefania Bruni CPS_ Tecnico di Laboratorio Biomedico Laboratorio di Fisiopatologia Endocrina Azienda Ospedaliero-Universitaria Sant Anna di

Dr.ssa Stefania Bruni CPS_ Tecnico di Laboratorio Biomedico Laboratorio di Fisiopatologia Endocrina Azienda Ospedaliero-Universitaria Sant Anna di Dr.ssa Stefania Bruni CPS_ Tecnico di Laboratorio Biomedico Laboratorio di Fisiopatologia Endocrina Azienda Ospedaliero-Universitaria Sant Anna di Ferrara Diagnostica Molecolare svolta nel Laboratorio

Dettagli

PURIFICAZIONE DI DNA

PURIFICAZIONE DI DNA PURIFICAZIONE DI DNA Esistono diverse metodiche per la purificazione di DNA da cellule microbiche, più o meno complesse secondo il grado di purezza e d integrità che si desidera ottenere. In tutti i casi

Dettagli

PCR (Polymerase Chain Reaction)

PCR (Polymerase Chain Reaction) PCR (Polymerase Chain Reaction) Metodo enzimatico estremamente rapido e semplice per produrre una quantità illimitata di copie della sequenza di un singolo gene Sometime a good idea comes to yow when you

Dettagli

Biologia molecolare clinica. Organizzazione del laboratorio di biologia molecolare clinica

Biologia molecolare clinica. Organizzazione del laboratorio di biologia molecolare clinica Biologia molecolare clinica Organizzazione del laboratorio di biologia molecolare clinica Le tecniche di biologia molecolare negli ultimi anni si sono diffuse nei laboratori di diagnostica clinica dove

Dettagli

Isolamento e purificazione di DNA e RNA. -Separare gli acidi nucleici da altri componenti cellulari (lipidi e proteine)

Isolamento e purificazione di DNA e RNA. -Separare gli acidi nucleici da altri componenti cellulari (lipidi e proteine) Isolamento e purificazione di DNA e RNA -Rompere la membrana cellulare -Separare gli acidi nucleici da altri componenti cellulari (lipidi e proteine) -Separare gli acidi nucleici tra loro -Rompere la membrana

Dettagli

13. Life Sciences Sommario

13. Life Sciences Sommario GENERAL CATALOGUE EDITION 8. Life Sciences Sommario Genomica 6 PCR 6 DNA-Elettroforesi 9 Gel-Documentation Filtrazione, Concentrazione 8 Proteomica ELISA Proteine-Elettroforesi 60 Blotting 6 Purificazione

Dettagli

QUESITI E RISPOSTE. Aggiornato al 19/09/2013

QUESITI E RISPOSTE. Aggiornato al 19/09/2013 ISTITUTO ZOOPROFILATTICO SPERIMENTALE DELLA LOMBARDIA E DELL'EMILIA ROMAGNA (ENTE SANITARIO DI DIRITTO PUBBLICO) ------------------------------------- BRESCIA Via Bianchi,/9 25124 BRESCIA Tel. 030-22901

Dettagli

ZytoLight SPEC ERG Dual Color Break Apart Probe

ZytoLight SPEC ERG Dual Color Break Apart Probe ZytoLight SPEC ERG Dual Color Break Apart Probe IVD Dispositivo medico-diagnostico in vitro Produttore: ZytoVision GmbH Codice: Z-2138-200 (0.2ml).. Per l identificazione della traslocazione che coinvolge

Dettagli

Corso di Laurea in Biotecnologie Anno-Accademico 2009-2010. Percorso nº 3: Clonaggio di segmenti di DNA

Corso di Laurea in Biotecnologie Anno-Accademico 2009-2010. Percorso nº 3: Clonaggio di segmenti di DNA Corso di Laurea in Biotecnologie Anno-Accademico 2009-2010 Percorso nº 3: Clonaggio di segmenti di DNA 11-5-2010 I plasmidi: un mondo da esplorare. Elementi genetici capaci di replicarsi autonomamente

Dettagli

Azienda Ospedaliero Universitaria Cagliari Servizio Provveditorato ed Economato. Via Ospedale, 54 09124 Cagliari Tel. 070/6092130 - Fax 070/6092288

Azienda Ospedaliero Universitaria Cagliari Servizio Provveditorato ed Economato. Via Ospedale, 54 09124 Cagliari Tel. 070/6092130 - Fax 070/6092288 Capitolato Tecnico Caratteristiche generali valide per fornitura in oggetto: Offerta tecnica 1.strumentazione la Ditta dovrà indicare la strumentazione che intende proporre che deve essere nuova di ultima

Dettagli

Metodi di laboratorio nel controllo microbiologico degli alimenti: classici ed innovativi

Metodi di laboratorio nel controllo microbiologico degli alimenti: classici ed innovativi Metodi di laboratorio nel controllo microbiologico degli alimenti: classici ed innovativi Torino, 10-11 Giugno 2013 S.S. Laboratorio Controllo Alimenti fabio.zuccon@izsto.it 1 Aspetti normativi Cosa tratteremo

Dettagli

Metodi: CEN/TC275/WG6/TAG4

Metodi: CEN/TC275/WG6/TAG4 Determinazione di HAV e Norovirus in molluschi bivalvi mediante Real time PCR Elisabetta Suffredini Istituto Superiore di Sanità Dipartimento di Sanità Pubblica Veterinaria e Sicurezza Alimentare Ancona

Dettagli

Immagine di una sequenza ben riuscita. Sequences troubleshooting

Immagine di una sequenza ben riuscita. Sequences troubleshooting Immagine di una sequenza ben riuscita. Sequences troubleshooting Sequenza fallita Reazione fallita: non presenta picchi definiti e ha un alto rumore di fondo. il primer non trova sito di annealing il DNA

Dettagli

(Atti non legislativi) REGOLAMENTI

(Atti non legislativi) REGOLAMENTI 3.3.2010 Gazzetta ufficiale dell Unione europea L 52/1 II (Atti non legislativi) REGOLAMENTI REGOLAMENTO (UE) N. 175/2010 DELLA COMMISSIONE del 2 marzo 2010 che attua la direttiva 2006/88/CE del Consiglio

Dettagli

Analisi di polimorfismi usati per la caratterizzazione di profili genetici in campioni di. DNA umano. 22-26 giugno 2009

Analisi di polimorfismi usati per la caratterizzazione di profili genetici in campioni di. DNA umano. 22-26 giugno 2009 Analisi di polimorfismi usati per la caratterizzazione di profili genetici in campioni di 22-26 giugno 2009 DNA umano 1 GENETICA FORENSE La genetica forense applica tecniche di biologia molecolare al fine

Dettagli

Kit MiSeqDx Universal 1.0 Guida di riferimento

Kit MiSeqDx Universal 1.0 Guida di riferimento Kit MiSeqDx Universal 1.0 Guida di riferimento PER USO DIAGNOSTICO IN VITRO Introduzione 3 Informazioni preliminari 7 Flusso di lavoro del protocollo 19 Preparazione del foglio campioni per MiSeqDx 20

Dettagli

PRINCIPALI APPLICAZIONI DELLA PCR. PRINCIPALI TIPI DI PCR a) PRINCIPALI TIPI DI PCR b) PRINCIPALI TIPI DI PCR a)

PRINCIPALI APPLICAZIONI DELLA PCR. PRINCIPALI TIPI DI PCR a) PRINCIPALI TIPI DI PCR b) PRINCIPALI TIPI DI PCR a) EAZIONE A CATENA DELLA POLIMEASI (PC) PINCIPALI APPLICAZIONI DELLA PC UPPE primer LOWE primer GENE X 1. Identificazione di agenti patogeni nell uomo, negli animali o negli alimenti (batteri e virus) 2.

Dettagli

Report tecnico sull esecuzione di RT-PCR per rilevazione contaminanti pro-infiammatori. Committente: Titanmed srl

Report tecnico sull esecuzione di RT-PCR per rilevazione contaminanti pro-infiammatori. Committente: Titanmed srl Report tecnico sull esecuzione di RT-PCR per rilevazione contaminanti pro-infiammatori Committente: Titanmed srl D O C U M E N T O R I S E R V A T O Scopo Lo scopo del lavoro era misurare l espressione,

Dettagli

METODI ALTERNATIVI. PCR digitale per la rilevazione e quantificazione. assoluta del DNA

METODI ALTERNATIVI. PCR digitale per la rilevazione e quantificazione. assoluta del DNA METODI ALTERNATIVI PCR digitale per la rilevazione e quantificazione assoluta del DNA Roma, 25 settembre 2013 Giuseppina Buonincontro IZS PLV- S.S. Controllo Alimenti La prima generazione di PCR consente

Dettagli

Analisi di sequenziamento degli acidi nucleici

Analisi di sequenziamento degli acidi nucleici Analisi di sequenziamento degli acidi nucleici In questa lezione darò qualche breve cenno sui metodi di sequenziamento del DNA e specialmente quelli con marcatura fluorescente che attualmente vengono effettuati

Dettagli

di Milazzo Gabriele Mangiagli Graziella Paternò Valentina Lomagno Valeria Mangione Enza Prof. C. Di Pietro

di Milazzo Gabriele Mangiagli Graziella Paternò Valentina Lomagno Valeria Mangione Enza Prof. C. Di Pietro di Milazzo Gabriele Mangiagli Graziella Paternò Valentina Lomagno Valeria Mangione Enza Prof. C. Di Pietro Polymerase Chain Reaction Inventata a metà degli anni 80 da Kary Mullis, è a tutt oggi uno strumento

Dettagli

CellSolutions General Cytology Preservative

CellSolutions General Cytology Preservative CellSolutions General Cytology Preservative Codice di catalogo: C-101 (10 ml fiala) C-101-25 (25 x 10 ml fiale) C-101-200 (8 x 25 x 10 ml fiale) C-101-500 (20 x 25 x 10 ml fiale) C-101L (1 L) C-101G (4

Dettagli

1. DESCRIZIONE DEL PRODOTTO

1. DESCRIZIONE DEL PRODOTTO Istruzioni per l uso HISTO SPOT SSO Kit Kit per test di tipizzazione tissutale HLA in biologia molecolare 96 Tipizzazioni IVD 0123 REF 726010: HISTO SPOT A 4D (96 test) Versione: 11/2013 REF 726020: HISTO

Dettagli

Protocollo di Real-Time RT-PCR per la diagnosi del fitoplasma della Moria del Pero. Claudio Ratti, Chiara Lanzoni e Carlo Poggi Pollini

Protocollo di Real-Time RT-PCR per la diagnosi del fitoplasma della Moria del Pero. Claudio Ratti, Chiara Lanzoni e Carlo Poggi Pollini Protocollo di Real-Time RT-PCR per la diagnosi del fitoplasma della Moria del Pero Claudio Ratti, Chiara Lanzoni e Carlo Poggi Pollini Moria del pero (Candidatus Phytoplasma pyri) Fitoplasmi: Microrganismi

Dettagli

ISOLAMENTO E PURIFICAZIONE DEGLI ACIDI NUCLEICI prof.ssa Daniela Gallo

ISOLAMENTO E PURIFICAZIONE DEGLI ACIDI NUCLEICI prof.ssa Daniela Gallo ISOLAMENTO E PURIFICAZIONE DEGLI ACIDI NUCLEICI prof.ssa Daniela Gallo INTRODUZIONE Acidi nucleici Gli acidi nucleici sono una famiglia eterogenea di macromolecole distribuite all interno di tutte le cellule

Dettagli

Lezione XLI-XLII martedì 17-1-2012

Lezione XLI-XLII martedì 17-1-2012 Lezione XLI-XLII martedì 17-1-2012 corso di genomica aula 8 orario : Martedì ore 14.00-16.00 Giovedì ore 13.00-15.00 Esami 31- gennaio 2012 7- febbraio 2012 28 - febbraio 2012 D. Frezza Esercitazione II

Dettagli

GENEQUALITY TAS QF-PCR v.2.0

GENEQUALITY TAS QF-PCR v.2.0 MANUALE D USO GENEQUALITY TAS QF-PCR v.2.0 cod. 04-25R-25B Sistema per la diagnosi di trisomie dei cromosomi 13-18-21 e di aneuploidie dei cromosomi sessuali GQ-TAS_QF-PCR_v.2.0_manuale_i20130911.docx

Dettagli

Corso di: GESTIONE FAUNISTICA. Prof. Bernardino Ragni

Corso di: GESTIONE FAUNISTICA. Prof. Bernardino Ragni Corso di: GESTIONE FAUNISTICA Prof. Bernardino Ragni Università degli Studi di Perugia Facoltà di Scienze Matematiche Fisiche Naturali Corso di laurea in Scienze Naturali LAUREA MAGISTRALE Caso di studio:

Dettagli

Un nuovo approccio: la VEQ in biologia molecolare

Un nuovo approccio: la VEQ in biologia molecolare Un nuovo approccio: la VEQ in biologia molecolare Il crescente interesse nella biologia molecolare applicata alla diagnostica è il risultato dei profondi progressi ottenuti nelle conoscenze scientifiche

Dettagli

Protocollo diagnostico per Candidatus Phytoplasma prunorum

Protocollo diagnostico per Candidatus Phytoplasma prunorum Protocollo diagnostico per Candidatus Phytoplasma prunorum 2 Descrizione della malattia Agente causale Tassonomia Candidatus Phytoplasma prunorum Classe: Mollicutes Gruppo ribosomico: 16SrX (AP - Apple

Dettagli

Sfrutta subito i Vantaggi! Validità 1 Aprile 30 Giugno 2005. Scopri la qualità e il risparmio!

Sfrutta subito i Vantaggi! Validità 1 Aprile 30 Giugno 2005. Scopri la qualità e il risparmio! www.eppendorf.com/advantage/32 Get Eppendorf quality today! Validità 1 Aprile 30 Giugno 2005 Sfrutta subito i Vantaggi! Scopri la qualità e il risparmio! www.eppendorf.com/advantage/32 Get Eppendorf quality

Dettagli

3 anni di garanzia (estesi a 5 con registrazione via web) F1 a volume variabile - singolo canale

3 anni di garanzia (estesi a 5 con registrazione via web) F1 a volume variabile - singolo canale Finnpipette F1 & F2 Facili da usare ed estremamente leggere. In più con 5 anni di garanzia. Performance d eccellenza, altissima ripetibilità. Puntali VWR Collection Compatti, tracciabili ed ecologici Le

Dettagli