ProDect CHIP HPV TYPING

Transcript

1 bcs Biotech SpA Your partner in biotechnology ProDect CHIP HPV TYPING Il test per RIVELARE e TIPIZZARE in maniera rapida ed accurata il PAPILLOMA VIRUS UMANO A lifi i Amplificazione e rivelazione delle regioni L1 ed E6/E7 i l i d ll i i L d E6/E

2 ProDect CHIP HPV TYPING CARATTERISTICHE Test diagnostico per la ricerca e la tipizzazione del DNA del Papilloma Virus Umano in sole 4 ore e30min. Bcs Biotech adotta la filosofia della qualità per offrire un test di alto livello ed elevata affidabilità. Il primo e unico kit che amplifica e rivela simultaneamente le regioni L1 ed E6/E7 di HPV e la β globina umana 96 CAMPIONI Rileva la positività rispetto a 19 tra i più diffusi tipi di HPV 5 a basso rischio oncogeno (6, 11, 42, 43, 44) 14 ad alto medio rischio oncogeno (16, 18, 31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 56, 58, 59, 68, 73) Il kit consente di amplificare contemporaneamente la regione L1 del DNA di HPV, la regione E6/E7 in riferimento a vari tipi HPV e la β globina umana. La rivelazione degli amplificati tramite ibridazione inversa consente di: tipizzare fino a 19 tipi rispetto alla regione L1, verificare la presenza di tipi ad alto rischio oncogeno eventualmente non tipizzabili su L1 (utilizzando come secondo target la regione E6/E7), controllare l intero processo di raccolta, estrazione ed amplificazione del DNA estratto dai campioni.

3 ProDect CHIP HPV TYPING ti permette la rilevazione precoce della più importante causa di cancro alla cervice e di altri tipi di tumori COMPOSIZIONE E TEMPI DEL KIT Ilkitcostituitodadueparti(AeB)ècompletodituttiireattivioccorrentiperlafasedi amplificazione e rivelazione. Il sistema di lettura è automatizzato con specifico software per la diagnosi. ProDect HPV Extraction cod. BCS291509HPV 100 ESTRAZIONE ProDect BCS Biochip Software cod. BCS ANALISI RISULTATI AMPLIFICAZIONE 2h ProDect Chip HPV Typing cod. BCS ProDect BCS Biochip Reader cod. BCS LETTURA RISULTATI RIVELAZIONE 2h Parte B Consente l amplificazione di 96 campioni in riferimento a due bersagli genetici: HPV e β globina umana. E costituita da: 4x1068 µl PCR mix; 50µl DNA polymerase; 500µl Controllo di ibridazione; 1,5ml Tampone di blocco 10x. Conservazione a 16/ 24 C. Parte A Consente l analisi/tipizzazione di 96 amplificati mediante sonde per 19 tipi HPV. E costituita da: 27µl Streptavidina; 12ml Tampone di ibridazione; 36ml Tampone di lavaggio; 1ml Tampone Maleico; 2ml Tampone di Rivelazione; 550µl Colorante; 12 Strip pre spottate; H 2 O Conservazione a 2/8 C. UTILIZZO DELLA β GLOBINA UMANA COME CONTROLLO DI ESTRAZIONE ED AMPLIFICAZIONE

4 Il kit si basa sull utilizzo di chip ai quali sono legate sonde specifiche per i diversi patogeni. L acido nucleico estratto dal campione viene sottoposto ad amplificazione genica tramite PCR Multiplex. I primer utilizzati sono marcati con biotina e di conseguenza anche gli amplificati che ne derivano. Questi ultimi vengono fatti ibridare su chip (con incubazione a temperatura ed agitazione controllate). Segue la fase di lavaggio e l aggiunta di una soluzione contenente streptavidina coniugata con fosfatasi alcalina (AP) (incubazione a RT). Dopo un ulteriore fase di lavaggio, viene aggiunto il cromogeno/substrato (NBT BCIP; BCIP incubazione i a RT) che media la reazione colorimetrica alla base della rivelazione. La presenza della sequenza bersaglio è evidenziata dalla formazione di un precipitato di colore bruno in corrispondenza della relativa sonda: ogni differente positivo da vita a pattern specifici. Il sistema rilevamediamente sino a 12.5 pg/ml dellesequenze bersaglioper ciascun tipo. STRUMENTAZIONE DEDICATA Il lettore di micropiastre ProDect BCS Biochip Reader (cod. BCS090786) è uno strumento completo e flessibile. Le sue prestazioni sono garantite da un esclusivo sistema di acquisizione a doppia CCD camera. L incubatore ProDect BCS Mini Oven (cod. BCS090787) consente un accurato controllo della temperatura e dell agitazione.

5 ANALISI DEI RISULTATI Il software ProDect BCS Biochip Software (cod. BCS090788) analizza le immagini rispetto a pattern predefiniti di riferimento, memorizza idatieproducei referti relativi all analisi. PATTERN INTERPRETATIVO C β Globina HPV 68 HPV 58 E6/E7 C Ibridazione HPV 43 HPV 45 HPV 73 HPV 31 HPV 33 HPV 18 C Negativo HPV 6/11 HPV 16 HPV 44 HPV 56 HPV 42 HPV 35 HPV 39 HPV 52 HPV 59 HPV 51 PRODOTTI CORRELATI CON IL KIT Sono disponibili i seguenti kit, costituiti da concentrazioni note di clonato HPV, come controlli standard qualitativi e quantitativi: ProDect QC HPV cod.bcs686081qchpv n tipo Controllo standard per la valutazione quantitativa delle procedure di biologia molecolare. Costituito da 3 vials contenenti 5μl x 4 diluizioni scalari (da a <100 copie totali) di un clonato HPV a scelta tra i diversi tipi: ProDect QHPV cod. BCS686081QHPV n tipo Controllo standard per la valutazione qualitativa delle procedure di biologia molecolare. Costituito da 5 vials contenenti 5μl di controllo positivo di un clonato HPV a scelta tra HPV e 5 vials contenenti 5μl di controllo negativo ProDect Q HPV Typing cod. BCS686081QHPV Typing Controllo standard per la valutazione qualitativa delle procedure di biologia molecolare. Costituito da: 1 vial contenenti 5μl di controllo positivo di tutti i seguenti clonati HPV: ; 17 vials contenenti 5μl di controllo negativo E il kit per l estrazione: ProDect HPV Extraction cod. BCS291509HPV Consente l estrazione di 100 campioni. Matrice di partenza: campioni freschi, congelati o inclusi in paraffina. Conservazione dei DNA estratti: < 20 C.

6 BIBLIOGRAFIA F.Piras, M.Piga, A.De Montis, M.Atzori, M.Pittau, D.Murtas, L.Minerba, C.Maxia, MT.Perra, P.Sirigu : Human papillomavirus type distribution and correlation with cyto histological patterns in women from Benin. Abstract presentato al 64 Congresso della Società Italiana di Anatomia e Istologia, Taormina Messina, Settembre, A.De Montis, C.Lauterio, C.Passotti, C.Frongia, M.Pittau, Michela Piga, A.Cerina, D.Casimiri, M.G.Schirru, P.L.Schirru: Relevance of E6/E7 region as further marker of HPV infection in diagnostic routine. Abstract presentato al 4 th European Congress of Virology. Cernobbio, 7 11 Aprile, S.Rolla, S.Vacca, E.Lavanga, D.Carcione, C.Lauterio, A.De Montis, M.Clementi: Valutazione di un nuovo sistema molecolare per il rilevamento e la tipizzazione di HPV DNA mediante analisi su microarray del prodotto di Multiplex PCR. Abstract presentato al 3 Congresso Nazionale della Società Italiana di Virologia Medica, Roma, 6 8 Maggio, C.Lauterio, G.Costa Marras, T.Pisanu, M.Marini, M.G.Murtas, M.Rais, A.De Montis: Human papilloma virus: diagnosis on a chip using Multiplex PCR. International Scientific Communication Laboratory Net, bcs Biotech SpA Your partner in biotechnology Indirizzo: Viale Monastir, Cagliari Italia Tel Fax e mail: biocs@tin.it Indirizzo web: SGQ 04/